مجموعه مصنفات حكيم مؤسس آقا على مدرس طهرانى - زنوزى، على بن عبد الله - الصفحة ٧٧ - ٨ منابع آثار آقا على
ذيمقراطيس، افلاطون، ارسطو، فورفوريوس و به كرات اثولوجيا مورد بحث و بررسى قرار گرفته است.
از ويژگىهاى مثبت حكيم مؤسس توجه و نقل مستند آراء حكماى معاصر خود است. از حكيمان قرن سيزدهم آقا على آرا حكماى ذيل را فراوان مورد بحث و نقد قرار داده است: فارغ از آراء حكيم سبزوارى و پدرش ملا عبد الله مدرس زنوزى آراء ملا محمد اسماعيل درب كوشكى اصفهانى بيشتر از ديگر حكيمان مورد عنايت و بحث آقا على بوده است.
در درجه بعدى آراء ملا احمد اردكانى مورد نقد عالمانه آقا على واقع شده است.
ملا على نورى، ملا محمد جعفر لاهيجى، ملا محمد على نورى، ميرزا حسن نورى، ملا نعيما طالقانى، ملا رضا تبريزى، ملا مصطفى قمشهاى مصطفى الحكماء از جمله حكيمانى هستند كه آرائشان به نحوى مورد نقد و بحث آقا على واقع شده است.
از ميان عرفاء آقا على به آراء شيخ اكبر محيى الدين عربى، صدر الدين قونوى، كمال الدين عبد الرزاق كاشانى و عبد الرحمن جامى استناد كرده است. در تفسير قرآن، تفسير مورد اتكاء و استناد آقا على تفسير صافى ملا محسن فيض كاشانى است. در استناد به روايات، نهج البلاغه، كافى، كتب شيخ صدوق، احتجاج طبرسى منابع مورد اتكاى آقا على هستند. هرچند روايات عالية المضامين كه در جوامع رايج روايى به چشم نمىخورند نيز مورد استفاده واقع شده است. در مباحث اصول فقه غير از آراء استادش ميرزا حسن آشتيانى، به رأى صاحب معالم نيز استناد شده است. اشعار حافظ، مولوى، شيخ محمود شبسترى، سعدى و فياض لاهيجى در آثار آقا على به چشم مىخورند.
آقا على معمولا صراحتا از صاحب رأى استنادى نام مىبرد، اما در مواردى ضمن استناد به نظريات اساتيدش از ذكر نام آنها خوددارى كرده، به احتمال قوى در موارد ياد شده مراد ملا آقاى قزوينى است. متأسفانه آثار حكماى قرن سيزدهم منتشر نشده تا بتوان در اين زمينه نظر قطعى داد. مقايسه ميزان استنادات آقا على مدرس به آراء ديگر حكما با ميزان استنادات حكيم سبزوارى نشان مىدهد كه حوزه تتبع و مراجعه حكيم مؤسس به مراتب