تضمنت فصول المعجم العديد من الآيات المفسرة بالإمام المهدي ٧ ، في أحاديث النبي ٦ والأئمة : ، وكلمات علماء التفسير . وهذا الفصل لما بقي منها ، وهو يدل على عمق عقيدة المهدي عجل الله تعالى فرجه الشريف في نسيج القرآن والإسلام .

ففي الكافي : ١ / ١٩٣ : « عن عبد الله بن سنان قال : سألت أبا عبد الله ٧ عن قول الله جل جلاله : وَعَدَ اللهُ الَّذِينَ آمَنُوا مِنْكُمْ وَعَمِلُوا الصَّالِحَاتِ لَيَسْتَخْلِفَنَّهُمْ فِي الأرض كَمَا اسْتَخْلَفَ الَّذِينَ مِنْ قَبْلِهِمْ ؟ قال : هم الأئمة : » .

وفي تأويل الآيات : ١ / ٣٦٨ : « نزلت في علي بن أبي طالب والأئمة من ولده : ، وعنى به ظهور القائم ٧ » .

النعماني / ٢٤٠ : « عن أبي عبد الله ٧ في معنى قوله عز وجل : وَعَدَ اللهُ الَّذِينَ آمَنُوا مِنْكُمْ وَعَمِلُوا الصَّالِحَاتِ لَيَسْتَخْلِفَنَّهُمْ فِي الأرض كَمَا اسْتَخْلَفَ الَّذِينَ مِنْ قَبْلِهِمْ . وَلَيُمَكِّنَنَّ لَهُمْ دِينَهُمُ الَّذِي ارْتَضَى لَهُمْ وَلَيُبَدِّلَنَّهُمْ مِنْ بَعْدِ خَوْفِهِمْ أَمْناً يَعْبُدُونَنِي لا يُشْرِكُونَ بِي شَيْئاً ؟ قال : نزلت في القائم وأصحابه » .

النعماني / ٢٧٦ : « عن يونس بن ظبيان ، عن أبي عبد الله ٧ قال : إذا كان ليلة الجمعة أهبط الرب تعالى ملكاً إلى السماء الدنيا ، فإذا طلع الفجر جلس ذلك الملك على العرش فوق البيت المعمور ، ونصب لمحمد وعلي والحسن والحسين : منابر من نور فيصعدون عليها ، وتجمع لهم الملائكة والنبيون والمؤمنون وتفتح أبواب السماء ، فإذا زالت الشمس قال رسول الله ٦ : يا رب ميعادك الذي وعدت به في كتابك . وهو هذه الآية : وَعَدَ اللهُ الَّذِينَ آمَنُوا مِنْكُمْ وَعَمِلُوا الصَّالِحَاتِ لَيَسْتَخْلِفَنَّهُمْ فِي الأرض كَمَا اسْتَخْلَفَ الَّذِينَ مِنْ قَبْلِهِمْ وَلَيُمَكِّنَنَّ لَهُمْ دِينَهُمُ الَّذِي ارْتَضَى لَهُمْ وَلَيُبَدِّلَنَّهُمْ مِنْ بَعْدِ خَوْفِهِمْ أَمْناً ، ثم يقول الملائكة والنبيون مثل ذلك ، ثم يخرُّ محمد وعلي والحسن والحسين سجداً ، ثم يقولون : يا رب إغضب فإنه قد هتك حريمك وقتل أصفياؤك وأذل عبادك الصالحون ! فيفعل الله ما يشاء . وذلك يوم معلوم » .

تفسير القمي : ١ / ١٤ : « وقوله : وَعَدَ اللهُ الَّذِينَ آمَنُوا مِنْكُمْ وَعَمِلُوا الصَّالِحَاتِ لَيَسْتَخْلِفَنَّهُمْ فِي الأرض ، نزلت في القائم من آل محمد ٦ » .