دومين پيام روشن حديث ثقلين براى امّت اسلام، مرجعيت علمى اهل بيت عليهم السلام است. در واقع، پذيرش همتايىِ اهل بيت با قرآن و مصونيت علم آنان، براى اثبات اين پيام، كافى است. اين، بدان معناست كه هيچ كس جز اهل بيت عليهم السلام نمى‌تواند حقايق قرآن را براى مردم، بازگو كند و آنان را با معارف ناب اسلام، آشنا سازد. امام صادق عليه السلام مى‌فرمايد:

إنَّ اللَّهَ عَلَّمَ نَبِيَّهُ التَّنزيلَ وَ التَّأويلَ، فَعَلَّمَهُ رَسولُ اللَّهِ صلى الله عليه و آله عَلِيّاً عليه السلام، قالَ: وَ عَلَّمَنا وَ اللَّهِ.[٦٤٠]

خداوند به پيامبرش تنزيل و تأويل آموخت. پيامبر خدا هم آنها را به على عليه السلام آموخت و به خدا سوگند، به ما هم ياد داد.

همه احاديثى كه بر جايگاه علمى اهل بيت عليهم السلام تأكيد دارند (مانند احاديثى كه آنان را «خزانه‌داران علم خداوند» و «وارثان علم انبيا» معرّفى مى‌كنند، يا سخن آنان را سخن پيامبر خدا مى‌شمرند)،[٦٤١] در واقع، بيانگر اين پيام و تأكيد كننده بر مرجعيت علمى اهل بيت عليهم السلام اند.

جالب توجّه است كه در برخى از گزارش‌هاى حديث ثقلين، به جايگاه علمى اهل بيت عليهم السلام نيز اشاره شده است.[٦٤٢] افزون بر اين، حديث ثقلين در تبيين مرجعيت‌

[٦٣٩]. ر. ك: ص ٢٤٧( بخش سوم/ فصل يكم: مهم‌ترين ويژگى‌هاى اهل بيت عليهم السلام/ پاكى).

[٦٤٠]. الكافى: ج ٧ ص ٤٤٢ ح ١٥، تهذيب الأحكام: ج ٨ ص ٢٨٦ ح ١٠٥٢.

[٦٤١]. ر. ك: ص ٤١١( بخش چهارم/ فصل يكم: ويژگى‌هاى علمى اهل بيت عليهم السلام).

[٦٤٢].« من دو چيز در ميان شما مى‌نهم كه اگر به آن دو چنگ زنيد، هرگز گم‌راه نمى‌شويد: كتاب خداوند عز و جل واهل بيتم كه همان عترت من اند. اى مردم! گوش كنيد. به من خبر رسيده است كه در كنار حوض‌[ كوثر] بر من وارد خواهيد شد و من در باره اين كه با اين دو چيز سترگ چه كرده‌ايد، از شما پرسش خواهم كرد. اين دو چيز سترگ، كتاب خداوند عز و جل و اهل بيت من اند. پس، از آنها پيشى نگيريد كه نابود مى‌شويد، و به آنها نياموزيد، كه داناتر از شمايند»( ص ٤٢٥ ح ٤٥٠).