آثار والد مكرمش ملا عبد الله مدرس زنوزى يعنى حواشى الزنوزى على حواشى الفياض على شرح القوشچى على التجريد و لمعات الهيه مهمترين اثر ملا عبد الله است. تعليقات لمعات الهيه تنها اثر فارسى جلد دوّم مجموعه است. بالاخره دو تعليقه مختصر تعليقة واحدة على الحواشى الجمالية على الحواشى الخفرية على شرح القوشچى، و تعليقة على حاشية رسالة سرّ القدر ابن سينا پايان بخش جلد دوّم اين مجموعه است.

در دنبال، به تفصيل به معرفى چهارده اثر ديگر آقا على در جلد سوّم مجموعه خواهيم پرداخت. بدايع الحكم مهمترين اثر حكيم مؤسس و يكى از پنج كتاب درجه اوّل فلسفه به زبان فارسى و يكى از ده كتاب درجه اوّل فلسفه اسلامى به قول مطلق، جلد چهارم مجموعه مصنفات حكيم مؤسس به حساب مى‌آيد.

پيشينه لقب فاخر حكيم مؤسّس‌

برخى از فلاسفه بواسطه درخشندگى و خدمات علميشان از جانب ديگر حكما به القابى كه گوياى جايگاه رفيع عقليشان است مفتخر شده‌اند، از آن جمله است: فيلسوف العرب (كندى)، معلم ثانى (فارابى)، شيخ الرئيس (ابن سينا)، شيخ اشراق (سهروردى)، امام المشككين (فخر الدين رازى)، عقل حادى عشر (خواجه نصير الدين طوسى)، معلم ثالث (ميرداماد)، سيّد المدّققين (صدر الدين دشتكى شيرازى)، صدر المتألهين (محمد بن ابراهيم قوامى شيرازى). آقا على مدرس طهرانى نيز بواسطه ابتكارات متعدد فلسفى، در زمان حياتش ملقب به عنوان برازنده «حكيم مؤسس» شد. تصرف وى در مبانى و ارائه تقريرهاى تازه از اصول صدرايى، نقد حكيمانه آراء فيلسوف پر آوازه شيراز، و ارائه نظرياتى جديد در نزديك بيست مسئله فلسفى از اسباب اين لقب است. ديدگاههاى بديع وى در مباحث معاد جسمانى، اعتبارات ماهيت، حمل، وجود رابط، علم و تقريرهاى تازه‌اى از مسائل اصالت وجود، وحدت وجود، بساطت وجود، حركت جوهرى، رابطه عرض و موضوع، قوس صعود و نزول و ... شاهدى براين مدعاست. علاوه بر مداركى كه بر رواج عنوان «حكيم مؤسس» در زمان حيات آقا على در صدر جلد اول مجموعه ارائه كرديم، در اين مجال به مدارك ديگرى در اين زمينه اشاره مى‌كنيم: