برحاشیه میر سید شریف حواشی متعددی نگاشته شده است. از آن جمله حاشیه ی «مصلح الدین مصطفی بن حسام رومی»، حاشیه ی «یوسف بن حسین کرماستی»، و حاشیه ی «شریف مرتضی».

نسخه های خطی:

٨ نسخه ی خطی در «کتابخانه ی آستان قدس رضوی (ع)» به شماره ١٤٥٥٢ کتابت سال ١٠٤١ه-.ق.، شماره ١٤٤٢٧ کتابت سال ١٠٥٠ه-.ق.، شماره ٤٠٤٩ کتابت سال ١٠٧٣ه-.ق.، شماره ٣٩٩٠ کتابت سال ١١١٤ه-.ق.، شماره ١٤٧٦٤ کتابت سال ١٢٣٢ه-.ق.، شماره ١٤٨٦٨ کتابت سال ١٢٣٣ه-.ق.، شماره ٣٩٩١ و شماره ٣٩٩٢ موجود است.

٣ نسخه ی خطی در «کتابخانه ی آستانه مقدسه حضرت فاطمه معصومه سلام الله علیها» به شماره ١/٣:١٣٥-٥٢٨٢ در ١٩٠ برگ، شماره ١/٤: ٩٢-٦٣٠٩ در ٢٤٩ برگ، کتابت سال ١٠٧٣ه-.ق. و شماره ٣٦١ در ٢١٧ برگ، کتابت سال ٩٩٧ه-.ق. موجود است.

١٠ نسخه ی خطی در «کتابخانه ی آیت الله العظمی مرعشی نجفی (ره)» به شماره ١٠٠ در ١٩٥ برگ، کتابت سال ١٠٦٠ه-.ق.، شماره ٨٢٦٤ در ١٩٤ برگ، شماره ٩٢٨٢ در ١٣٣ برگ، شماره ١/١١٤٨٦ در ٤٢ برگ، کتابت ١١٧٧ه-.ق.، شماره ١٢٠٠٩ در ١٦١ برگ، کتابت سال ٨٩٨ه-.ق.، شماره ١٦٧٦ در ٢٠٣ برگ، کتابت سال ١٠٥٤ه-.ق.، شماره ٢٢٧٤ در ١٤١ برگ، شماره ٤٦٦٦ در ٩٣ برگ، کتابت سال ٨٦٤ه-.ق.، نسخه ی بسیار قدیمی، به خط «موسی بن نعمه بن حسن بن ابراهیم»، شماره ١٣١٦٣ در ١٠٧ برگ، کتابت سال ٨٦٤ه-.ق. (مثل نسخه ی پیشین) و شماره ٦٧٠١ در ١٦٠ برگ، کتابت سده ١٢ه-.ق. موجود است.

١ نسخه ی خطی در «کتابخانه ی آیت الله العظمی گلپایگانی (ره)» به شماره ١٨٨٣ موجود است.

٢ نسخه ی خطی در «کتابخانه ی بابانیین» وابسته به «کتابخانه ی اوقاف سلیمانیه» به شماره ٢٧ در ١٦٠ برگ و شماره ١٩٤ در ١١٣ برگ، کتابت سال ١٢١٠ه-.ق. موجود است.

١ نسخه ی خطی در «کتابخانه ی دانشگاه امارات متحده عربی» به شماره ٢٣١ در ١٤٧ برگ موجود است.

٣ نسخه ی خطی در «کتابخانه ی جامع کبیر صنعا» به شماره ١٦٢٣ در ٢٥٦ برگ، کتابت سال ١٠٦٢ه-.ق.، شماره ١٦٣٩ در ٢٤٦ برگ و شماره ٢٢٨٥ در ١٢١ برگ موجود است.

٢ نسخه ی خطی در «کتابخانه ی مسجد جامع گوهر شاد» به شماره ٨٧٣ در ١٩١ برگ و شماره ١١٤٨ موجود است.