او كه در زندگى به‌سان جدش حضرت موسى بن جعفر عليهما السلام به طاغوت عصر خود مبتلا شده بود، پس از وفات نيز همانند جده مظلومه‌اش حضرت زهرا عليها السّلام به خاك سپرده شد.

در نيمه‌هاى شب با حضور مأموران امنيتى رژيم بعث، پيكر پاكش غريبانه و مظلومانه و بدون تشييع، پس از نماز توسط حضرت آيت اللّه حاج سيد على سيستانى وسيله چند تن از خويشانش در مسجد خضراء سر به تيره تراب سپرد.

انتشار اين خبر موجب برقرارى حكومت نظامى در نجف و كوفه و آماده‌باش نيروهاى نظامى در بغداد، شهرهاى مركزى و جنوبى عراق و منع گردهمايى در اين دو شهر و تفتيش و بازرسى افراد و اتومبيلها شده و مأموران حكومتى در نقاط ورودى اين دو شهر و اطراف صحن حضرت على عليه السّلام و منزل ايشان در كوفه مستقر شدند و از برگزارى هرگونه مجلس يادبود و گراميداشت از سوى بيت و مقلدين و وكلاى ايشان جلوگيرى شد. اما در ايران، از نخستين ساعات بامداد روز نهم صفر صداى قرآن از راديو و مأذنه‌هاى حسينيه‌ها و مساجد پخش شد و از سوى دولت جمهورى اسلامى سه روز عزاى عمومى اعلام شد، و تمام در و ديوار شهرها و روستاها سياه‌پوش گرديد، و مردم به نوحه‌خوانى و عزادارى پرداختند.

از سوى رهبر معظم انقلاب، مراجع تقليد و علماى اعلام رؤساى قواى مجريه، مقننه، و قضاييه، شخصيتها، نهادها، سازمانها، انجمنهاى اسلامى، هيئتهاى مذهبى پيامهاى تسليت صادر و مجالس بزرگداشت بسيار برگزار گرديد.

همچنين شعرا به مرثيه‌سرايى و خطبا به سخنرانى در عظمت مقام علمى و عملى مرجع فقيد پرداخته و در كشورهاى مختلف جهان از هند و كشمير و افغان و پاكستان و بنگلادش و كويت و سوريه و لبنان و امارات و خليج‌فارس گرفته تا آمريكا