١. مرحوم آيت اللّه حاج سيد نصر اللّه موسوى مستنبط (١٣٢٧- ١٤٠٦ ه. ق) وى از شاگردان آيات عظام آقا ضياء عراقى و محقق اصفهانى و سيد ابو الحسن اصفهانى و آميرزا على آقاى قاضى و مورد علاقه شديد آيت اللّه فقيد بود. هنگام ضرورت به جاى مرجع بزرگوار اقامه جماعت نموده و يكى از مدرسان برجسته و مشهور حوزه علمى نجف به شمار مى‌رفت. برخى از آثار وى عبارتند از: اجتهاد و تقليد، تقيه، عدالت، قاعده من ادرك، قاعده تجاوز و فراغ و ...

مرجع بزرگوار در رثايش قصيده‌اى عالى و طولانى سرود و بدين‌گونه اندوه خويش را نمايان ساخت.

٢. حاج سيد جلال الدين فقيه ايمانى‌

ايشان بر تمام مؤسسات وابسته به آيت اللّه فقيد در ايران اشراف و نظارت دارد و چاپ مجلدات باقيمانده كتاب «جامع احاديث الشيعه» زير نظر وى ادامه يافته و به خدمات دينى و اجتماعى موفق مى‌باشد.

٣. مرحوم آقاى حاج سيد مرتضى حكمى‌

٤. حاج سيد محمود حسينى ميلانى نوه مرحوم آيت اللّه ميلانى وى هم اينك در زندان رژيم عراق به سر مى‌برد (خبر شهادت او به همراه علماى ديگر نجف، واصل شد).

٥. حاج شيخ جعفر غروى نائينى، نوه مرحوم ميرزاى نائينى‌

مؤسسات خيريه‌

آيت اللّه خويى همواره در جهت رفع نيازمنديهاى فرهنگى و دينى، اجتماعى، اقتصادى و ... شيعيان گام برداشته و مؤسسات زنجيره‌اى ايشان در گوشه و كنار جهان شاهد صدق اين مدعا است. به غير از احداث و تأسيس صدها مسجد،[١]

[١]. حجت الاسلام و المسلمين آقاى سيد محمّد موسوى نماينده آيت اللّه فقيد در هندوستان مى‌گويد: در هند يك هزار مسجد به فرمان ايشان بنا شده است.