وذكر محمد بن إسماعيل النيسابوري أنه هجم عليه محمد بن طاهر ، وأمر بقطع لسانه ويديه ورجليه ، وبضربه ألف سوط وبصلبه ، لسعايةٍ كان سُعِيَ بها إليه معروفة ، سعى بها محمد بن يحيى الرازي وابن البغوي وإبراهيم بن صالح ، لحديثٍ رواه محمد بن يحيى لعمر بن الخطاب ، فقال أبو يحيى : ليس هو عمر بن الخطاب وإنما هو عمر بن شاكر ، فجمع الفقهاء ، فشهد مسلم أنه على ما قال : وهو عمر بن شاكر ، وأنكر ذلك أبو عبد الله المروزي وكتمه ، بسبب محمد بن يحيى منه ، وكان أبو يحيى قال : هما يشهدان لي ، فلما شهد مسلم قال : غير هذا شاهد إن لم يشهدا ، فشهد بعد ذلك المجلس عنده رجل علمه !

فمن كتبه : كتاب خلاف عمر برواية الحشوية ، كتاب محنة النائبة ، يصف فيه مذاهب الحشوية وفضائحهم ، كتاب مفاخرة البكرية والعمرية ، كتاب الرد على الأخبار الكاذبة ، يشرح فيه نقض كل ما رووه من الفضائل لسلفهم ، كتاب مناظرة الشيعي والمرجي في المسح على الخفين وأكل الجري وغير ذلك ، كتاب الغوغاء من أصناف الأمة من المرجئة والقدرية والخوارج ، كتاب المتعة والرجعة والمسح على الخفين وطلاق المتعة ، كتاب التسوية ، بين فيه خطأ من حرم تزويج العرب في الموالي ، كتاب الصهاكي ، كتاب فضايح الحشوية ، كتاب التفويض ، كتاب الأوائل ، كتاب طلاق المجنون ، كتاب استنباط