حضرت در فراز ٣ و ٤ اين خطبه به انگيزه‌هاى جهاد و ويژگى‌هاى فرماندهى كل قوا اشاره مى‌كند. ١ ١. شرح خويى، ٨/ ٢٥٦.
١. انگيزه جهاد در اسلام الهى است نه قدرت‌طلبى و فزون خواهى: هدف از جهاد و مبارزه در اسلام، قدرت‌طلبى و رقابت در به دست گرفتن حكومت نيست.
نيز به دست آوردن غنايم و ثروت و سرزمين ديگران، از اهداف جهاد به شمار نمى‌رود. ١ اللَّهُمَّ إِنَّكَ تَعْلَمُ أَنَّهُ لَمْ يَكُنِ الَّذِي كَانَ مِنَّا مُنَافَسَةً ... مِنْ فُضُولِ الْحُطَامِ‌ ١. جهاد/ ٥٨.
٢. زنده كردن نشانه‌هاى دين، از اهداف جهاد در اسلام: امام على (ع) در بيان اهداف جهاد در اسلام، بازگرداندن نشانه‌هاى راه هدايت و رشد ملت‌ها و نيز رشد فكرى دادن به مردم در جهت انتخاب راه درست را بر مى‌شمارد، تا مردم در پناه جهاد از سلطه دشمنان برهند و در آزادى و آسودگى به آن نشانه‌ها بينديشند و راه حق را بازيابند. ١ وَ لَكِنْ لِنَرِدَ الْمَعَالِمَ مِنْ دِينِكَ‌ ١. جهاد/ ٥٩.
٣. اصلاح و آبادانى شهرها، از اهداف جهاد: از ديگر اهداف جهاد، بازسازى جامعه‌ها و اصلاح كشورها، جبران عقب افتادگى‌ها و كم كارى‌هاست. با جهاد، سرزمين‌ها اصلاح مى‌شوند. ١ وَ نُظْهِرَ الْإِصْلَاحَ فِي بِلَادِكَ‌ ١. شرح جعفرى ٢٣/ ٣٧- ٣٨.
٤. آرامش و ايجاد امنيّت براى ستمديدگان، از آثار جهاد: پس از جهاد، جامعه‌ها اصلاح شده، بازسازى مى‌گردند و ستمديدگان فرصت مى‌يابند كه در پناه امنيت حاصل آمده از جهاد، در پى منافع مشروع دنيايى و اخروى خود باشند. ١ فَيَأْمَنَ الْمَظْلُومُونَ مِنْ عِبَادِكَ‌ ١. جهاد/ ٦٠.
٥. اجراى حدود الهى زمين مانده، از آثار جهاد در اسلام: از آثار مهم جهاد در راه خدا، اجراى آن دسته از حدود الهى است كه به دليل حاكميت افراد غيرصالح،