بعد از پيروزى انقلاب اسلامى در ايران، پاكستان اولين كشورى بود كه دولت اسلامى را در ايران به رسميت شناخت. پاكستان در تحريم اقتصادى غرب عليه ايران شركت نكرد و در جريان جنگ تحميلى عراق عليه ايران، اعلام بى‌طرفى كرد. حضور حضرت آيةاللَّه خامنه‌اى رييس جمهورى وقت جمهورى اسلامى ايران به دعوت ضياء الحق در تاريخ ٢٣/ ١٠/ ١٣٦٤ در رأس يك هيئت بلند پايه به پاكستان مورد استقبال بى‌نظير حكومت و مردم پاكستان قرار گرفت. مقام معظم رهبرى در جمع مردم لاهور طى سخنانى اعلام داشتند:
پيام مردم ايران به شما وحدت و اتحاد و پيام اسلام و قرآن، مبنى بر مقابله و مبارزه با همه سلطه جهانى است. پيام اساسى ما به همه مسلمين جهان در دو جمله نهفته است: «بازگشت به اسلام و تمسك به قرآن و عدم گرايش به سلطه جهانخواران و مقابله با آنها كه براى غارت مسلمين همدست شده‌اند.» «١» در اين لحظه مردم با شعار مرگ بر آمريكا سخنان مقام معظم رهبرى را تأييد كردند. «٢» ضياء الحق رييس جمهور وقت پاكستان در ادامه سخنان رهبرى معظم انقلاب در سخنانى كوتاه اعلام داشت:
آقاى خامنه‌اى يك روحانى برجسته، مدير معروف و راهنماى عظيم در عصر حاضر هستند و همه جهان ستايشگر حريت فكرشان مى‌باشد و در پاكستان نيز مردم براى ايشان احترام زيادى قايل هستند. انقلاب اسلامى ايران يكى از رويدادهاى بزرگ عصر ماست كه تمام عالم اسلام را تحت تأثير خود قرار داده است و ما از ته دل به آنان خير مقدم گفته و رهبرى اين انقلاب را مورد تجليل و تقدير قرار مى‌دهيم. «٣» مهم‌ترين مشكل ارتباطى بين ايران و پاكستان به غير از حضور نامشروع آمريكا در اين كشور و تحريك پاكستان عليه ايران، بعضى از گروههاى وهابى مانند سپاه جهنگوى هستند كه همواره تلاش كرده‌اند ارتباط بين دو كشور را مخدوش بكنند. آمريكا و اسراييل تلاش زيادى مى‌كنند كه همكارى ايران و پاكستان را در سطح منطقه و جهانى كاهش دهند. آمريكا بارها آشكارا و پنهان كوشيد تا پاكستان رابطه‌اش را با ايران قطع كند. «٤» رهبر معظم انقلاب اسلامى در دوره‌هاى مختلف سعى كرده است با آگاهى دادن دو ملت، از