٢- في الفقه:وفي دراسته الفقهية، فقد حددت المصادر: بأنه قضي معه قرابة خمس وأربعين سنة، تسع منها مع آية الله العظمي الشيخ حسين الحلي (طيب الله ثراه) والباقي مع آية الله العظمى السيد الخوئي (عطر الله مرقده).
فقد حضر (رحمه الله)دورة كاملة، ابتدأها مع شيخنا الحلي بتاريخ ١٠/ جمادي الثانية/ ١٣٧٥ هـ بالإجتهاد والتقليد، ثم بحث الطهارة من العروة الوثقى.
وشرع في دروسه الفقهية مع السيد الخوئي ببحث الصلاة بتاريخ شوال ١٣٨٤هـ، واستمر معه في دورته الفقهية علي العروة الوثقي حتي نهاية كتاب الحدود بتاريخ ٢٦/ ربيع الثاني/ ١٤١٠هـ.
وبهذا يكون الشهيد السعيد آية الله السيد علاءالدين بحرالعلوم خلَّف للمكتبة العلمية الفقهية (٢٧مجلداً) تشتمل علي كل تقريرات العلمين الكبيرين السيد الخوئي والشيخ الحلي في الفقه، وهي:
١- سبعة مجلدات تقرير بحث الشيخ الحلي في الفقه ابتدأ من سنة ١٣٧٤هـ وحتى سنة ١٣٨٣هـ.
٢- أربعة عشر مجلداً لتقرير بحث السيد الخوئي الفقهي ابتدأ من سنة ١٣٨٤هـ وحتى سنة ١٤١٠هـ.
٣- مجلد واحد يحتوي على عدد من الرسائل:
- رسالة في إرث الزوجة كتبها سنة ١٣٩٣هـ.
- رسالة في الإرادة كتبها سنة ١٣٩٨هـ.
- رسالة في متعة الحج والنساء كتبها سنة ١٤٠٣هـ.
٤- وفي أثناء ذلك حضر دروس الشيخ الحلي الذي كان يلقيها، وذلك في سنوات ١٣٧٦ و١٣٧٨ و١٣٨١هـ، وقد بحث فيها مواضيع متعددة في التقية، وصلاة الجمعة، والوطن، والتأمين، واليانصيب، وغيرها من البحوث التي لها علاقة بالمجتمع، والتي تسمي في مصطلح اليوم ب- «المسائل المستحدثة».