وأمّا على صعيد البحث الاُصولي فقد تمّ إنجاز بحث حجية الاُصول المثبتة ، كما دوّنت رسائل وبحوث في علوم القرآن وبعض المسائل المستحدثة ، وإليك بعض عناوينها :

أصالة الصحة ، نقل أعضاء البدن ، أحكام الشروط في العقد ، أصالة اللزوم ، حكم أهل الكتاب ، الإسراف في الكتاب والسنّة ، مسؤولية الطبيب وضمانه ، الاستصحاب في الموضوعات المركّبة ، الغناء ، نجاسة الخمر ، حكم التصوير ، المؤونة المستثناة في الخمس ، وجوب خمس أرباح المكاسب ، إجزاء الأغسال عن الوضوء ، الحكومة والورود ، قضاء ولي الميت ، التسامح في أدلّة السنن ، العرف والمتعارف ، الكلام في ثبوت الولاية على الباكرة الرشيدة في أمر الزواج ، حول كلام الشيخ في عدّة لا يروون ولا يرسلون إلاّ عن ثقة .

ومن المشاريع العلمية التي يتم العمل عليها الآن في المؤسسة إنجاز شرح كامل على كتاب وسائل الشيعة ، وهو مصدر مهم يرجع إليه الفقهاء ولكن لم يتسنَّ إلى الآن شرح يناسبه ، وقد أعدّت مؤسستنا لتدوين هذا الشرح عشرة محاور وهيكلية عامّة لفصوله .

وقد بدأ العمل على هذا الشرح منذ تأسيس المؤسسة ، وتمّ إلى الآن إعداد الكثير من البطاقات في مجالات عديدة ومختلفة ، ويتمحور البحث حول كل حديث في محورين : ١ ـ السند . ٢ ـ المتن .

وهناك عشرة نقاط أو محاور في مرحلة بحث السند .

ويتمّ تحليل وبيان الوجه في تصنيف كل حديث ضمن التصنيف الرباعي للحديث في الصحيح والحسن والموثق والضعيف ، وكذلك الأوصاف غير المعروفة كالمعلّق والمعلّل وغيرها .