الاَوّل: في الاَُمور العامة التي تطلق عليها الاِلهيات بالمعنى الاَعم، ويبحث فيه عن الوجود والعدم وأحكام الماهيات، والمواد الثلاث: الوجود والاِمكان والامتناع، والقدم والحدوث، و العلّة والمعلول، وغيرها من المسائل التي تبحث عن أحكام الوجود بما هوهو.

الثاني: في الجواهر والاَعراض التي يطلق عليها الطبيعيات، ويبحث فيه عن الاَجسام الفلكية و العنصرية والاَعراض التسعة، على وجه التفصيل.

الثالث: في الاِلهيات بالمعنى الاَخص، ويبحث فيه عن الاَُصول الخمسة.

وبما أنّ المحور الاَوّل هو المقصد الاَهم للحكماء من المشائين والاِشراقيين، وقد بحثوا عنه في الاَُمور العامة على وجه التفصيل والاستيعاب، حتى خصّص صدر المتألهين ثلاثة أجزاء من كتابه «الاَسفار» بمباحث هذا المحور ـ لاَجل ذلك ـ استغنى الطلاب عن دراسة هذا المقصد من كتاب كشف المراد.

وبما أنّ العلوم الجديدة الباحثة عن الطبيعة وأحكامها قد قطعت أشواطاً كبيرة، وأبطلت كثيراً من الفروض العلمية في الفلكيات والاَكوان، فأصبح ما يبحث في الكتب الكلامية والفلسفية في هذا القسم تاريخاً للعلم الطبيعي لا نفسه، ولاَجل ذلك تركت دراسة المحور الثاني في الكتب الكلامية والفلسفية في أعصارنا.

فلم يبق إلاّ المحور الثالث الموسوم بالاِلهيات بالمعنى الاَخص الذي يبحث فيه عن ذاته سبحانه وصفاته وأفعاله، ولاَجل ذلك عكف المحصلون على دراسة هذا المحور الذي يتضمن البحث عن إثبات الصانع وصفاته وأفعاله،