عاد سماحة السيد فضل الله إلى لبنان في العام ١٩٦٦ م ، على أثر دعوة وجّهها إليه مجموعة من المؤمنين الذين أسسوا جمعية أسرة التآخي التي تهتم بالعمل الثقافي الإسلامي الملتزم ، من خلال شعورهم بمدى حاجة الساحة الإسلامية اللبنانية إلى سماحته ، لم ينقطع عن العطاء العلمي ، فأسس حوزة ( المعهد الشرعي الإسلامي ) ، وشكّل بذلك نقطة البداية لكثير من طلاب العلوم الدينية ، وقد تخرج على يديه كثير من العلماء البارزين في الوسط اللبناني ، وما يزال المعهد قائماً حتى وقتنا الراهن .

شرع سماحته بإلقاء ( دروس البحث الخارج ) (٣) في الفقه والاُصول على طلاب العلم منذ ما يزيد عن العشرين عاماً ، ويحضر درسه في بيروت ما يزيد عن المئة طالب من اللبنانيين والعراقيين وغيرهم ، وقد درس على يديه العديد من أهل العلم والفضل وأساتذة الحوزة وقد صدرت تقريرات لبعض أبحاثه ، من قبيل : النكاح والرضاع والوصية والمواريث والقضاء ، وغيرها ، بالإضافة إلى مئات أشرطة التسجيل الصوتي في الأبواب الفقهية والاُصولية المتنوّعة .

بالاضافة إلى عطائه العلمي فقد كان للمرجع الراحل عطاءات اجتماعية وانسانية كبيرة ترجمتها مشاريع المبرّات ودور الأيتام المعروفة والمساعدات الانسانية وغيرها .

(٣) البحث الخارج : المراد به الدروس التي تُلقى على الطبقة المتقدّمة من طلبة العلوم الدينية لتهيئتهم للاجتهاد .