در تاريخ اسلام، نخستين گروه بغات و شورشگران عليه حكومت اسلامى، گروه بغات در زمان حكومت امير مؤمنان عليه السلام بودند كه با عناوين قاسطين، ناكثين و مارقين، خوانده مى‌شوند. اينان، با شعارهاى ظاهر فريب، حدود پنج سال، چرخه پيشرفت حكومت اسلامى را كند كردند و سرانجام، چراغ پرفروغ عدالت را خاموش ساختند و بدين وسيله زمينه را براى پا گرفتن حكومت ستمگران و باطل‌گرايان و به قدرت رسيدن دشمنان اسلام، فراهم ساختند.
بغات، در دوران حكومت اميرمؤمنان عليه السلام با ظاهرى آراسته به دين و تمسّك ظاهرى به قرآن و شعارهاى فريبنده، در مقابل آن امام معصوم عليه السلام قيام كردند و عليه آن حضرت شمشير كشيدند. خطر بغات، بسى بيشتر از خطر مشركان است؛ زيرا باغايان، اهل قبله و مسلمانند و به دليل شبهه در دين، انحراف و كجى، تأويل (: تفسير به رأى) قرآن، و تعصب كوركورانه، به انحراف كشيده شده و از صراط مستقيم و حق دور گشته‌اند. «١» «امام على عليه السلام فرمود: «لكِنَّا اصْبَحْنا نُقاتِلُ اخْوانَنا فِى‌الْاسْلامِ عَلى ما دَخَلَ فيهِ مِنَ الشُّبْهَةِ وَ الزَّيْغِ وَ التَّأْويلِ وَالْاعْوِجاجِ.» تنها، امير مؤمنان عليه السلام در نبرد با بغات پيشگام بود و بدون هيچ‌گونه ترديد و اغماض و مسامحه‌اى به دفع اين فتنه‌گران برخاست و براى زدن گردن كسانى كه در دين خدا بدعت نهاده و ميان مسلمانان به فساد و فتنه‌گرى پرداخته بودند و قصد براندازى حكومت اسلامى را داشتند، شمشير از نيام بركشيد. آن حضرت فرمود:
«الا وَ قَدْ امَرَنِىَ‌اللَّهُ بِقِتالِ اهْلِ الْبَغْىِ وَالنَّكْثِ وَالْفَسادِ فِى الْارْضِ. فَامَّا النَّاكِثُونَ فَقَدْ قاتَلْتُ وَ امَّا الْقاسِطُونَ فَقَدْ جاهَدْتُ وَ امَّا الْمارِقَةُ فَقَدْ دَوَّخْتُ.» «٢» آگاه باشيد، خداوند مرا دستور داده با تجاوز كاران و پيمان‌گسلان و تبهكاران در زمين پيكار كنم. امّا با پيمان شكنان (اصحاب جمل) جنگيدم و با از حق بيرون شدگان، (اصحاب صفين) ستيز كردم و دين بيرون شدگان (خوارج نهروان) را زبون ساختم.