ايجاد جامعه اسلامى مطلوب، تصويب طرحهاى مناسب براى بسيج امكانات و جلب همكارى مردم، بسيج ادارات و موسسات دولتى براى اجراى طرحهاى جهادسازندگى را بر عهده داشت. همين وظايف را در سطح محدودتر، شوراهاى جهادسازندگى استان و شهرستان بر عهده داشتند. تهيه و پيشنهاد طرح ها و برنامه ها به شوراها در سطوح مختلف برنامه‌ريزى اجرائى و نظارت و ارزشيابى عملكرد واحدهاى اجرائى در رابطه با پيشرفت طرحها و ارائه راهنمايى‌هاى فنى به واحدهاى اجرائى در زمره وظايف هيئتهاى اجرائى در سطح كل، استان و شهرستان قلمداد شده بود.

گروههاى تخصصى و واحدهاى اجرائى كه شامل گروههائى نظير گروه فرهنگى، گروه بهداشتى و درمانى، گروه كشاورزى و اقتصادى و گروه عمرانى و فنى بودند، مسئوليت اجراى طرحهاى جهاد و تصميمات هيئتهاى اجرائى را برعهده داشتند و بطور كلى ساخت تشكيلاتى پيش‌بينى شده در اساسنامه مذكور براساس سه سطح متفاوت سازمانى طرح ريزى شده بود، به نحوى كه شوراها مسئوليت سياستگذارى، برنامه‌ريزى و تعيين خطمشى را بر عهده داشتند.

برنامه‌ريزى اجرائى و نظارت بر عملكرد واحدهاى اجرائى و هدايت امور اجرائى به هيئتهاى اجرائى محول شده بود و واحدهاى اجرائى گروههاى تخصصى، كار امور اجرائى را بر عهده داشتند. يكى از مشكلات مهم جهاد در اين دوره، مسأله مديريت اين تشكل جديد بود، زيرا دانشجويان، خواهان حركت وسيع و به دور از بوروكراسى زائد بودند و دولت وقت خواهان نظارت رسمى و دولتى بر اين حركت بود و به همين جهت مسأله تأمين امكانات و بودجه براى اين حركت به تدريج به صورت موضوع حادى مطرح شد.

در ماههاى اوليه تأسيس جهاد به دليل تعطيل بودن مدارس و بالا بودن آمادگيهاى مردمى و كمكهاى مردمى فراوان، كار سازندگى روستاها با حضور مستقيم مردم و در ابعاد مختلف آغاز شد و بيشتر كار جهادسازندگى معطوف به ايجاد هماهنگى و اطلاع رسانى مى‌شد.

معتمدين محلى در بازار راه مى‌افتادند و براى جهادسازندگى كمك مالى جمع‌آورى مى‌كردند و به اين طريق از ركود كارها جلوگيرى بعمل مى‌آمد. هنگامى كه مشكلات مديريتى و مالى زياد شد، موضوع در شوراى انقلاب مطرح و قرار شد براى رسيدگى به‌