ادامه اعتراض و مظلوم نمایی در شهرهای مختلف به بهانه حمله گروه ها به اماکن و دفاتر سازمان و نیز اعتراض به پاک سازی در ادارات؛ "شهیدنمایی" و "مظلوم نمایی" به جای هرگونه پاسخ گویی در قبال مواضع انحرافی ایدئولوژیک و سیاسی - اجتماعی سازمان و تلاش برای تشدید و بزرگ نمایی اختلافات دو جناح حکومتی؛ تشدید فعالیت هواداران سازمان در برهم زدن اجتماعات مذهبی و ایجاد درگیری و تشنج به خصوص در ماه مبارک رمضان، ازجمله برهم زدن سخنرانی جواد منصوری در شب احیای دانشگاه امام صادق(ع) در شب ٢١ رمضان سال ١٣٥٩؛ جمع آوری و اخفای سلاح و مهمات در شهرهای مختلف (یک انبار بزرگ سلاح و مهمات از عزتالله کفایتی در شهرستان محلات در ١٧ مرداد ١٣٥٩ کشف شد)؛ ایجاد درگیری و جدال های بعضاً خونین در تهران و شهرهای کوچک و بزرگ دیگر بر سر دستگیری و محاکمه سعادتی از اعضای کادر مرکزی سازمان که به جرم جاسوسی برای شوروی دستگیر و زندانی شده بود و جنجال هواداران این سازمان در شهرهای مختلف برای آزادسازی وی؛ همچنین گشودن یک جبهه وسیع جنگ داخلی در ایران با بحران آفرینی و اجرای عملیات روانی و تلاش برای منحرف کردن اذهان مسئولان نظام و امکانات جمهوری اسلامی و مشغول کردن بخشی از نیروها و امکانات کشور جهت پاسخ گویی به این گونه بحران ها.

مواضع سازمان مجاهدین خلق (منافقین) از بدو انقلاب اسلامی و به ویژه در دوره سوم باعث شد تا امام خمینی به شدت از این گونه گروه ها انتقاد کند. امام خمینی در ٤/٤/١٣٥٩، درباره توطئه گروه های خلقی علیه انقلاب فرمودند:

«اینهایی که در کنار جمهوری اسلامی هستند و می خواهند به اسم جمهوری اسلامی، به اسم اسلام، به اسم خلق، به اسم ملت کار بکنند، اینها را ببینید چه می کنند. ممکن است من هی بگویم اسلام، هی بگویم فدایی خلق و هی بگویم مجاهد اسلام و مجاهد خلق، این حرف ها را بزنم، لیکن وقتی که اعمال من را شما ملاحظه می کنید، ببینید که از اول من مخالفت کردم، در هرجا تفنگ کشیدم و مخالفت کردم و هرجا بنا بود یک اصلاحی بشود، شما دیدید که من آمدم و مقابلش ایستادم و مشتم را گره کردم و تفنگم را کشیدم... یک وقت می بینید که از همه اطراف، این گروه هایی که این مفسده ها و این میکروب ها را درست می کنند جمع می شوند و در کردستان و آنجا فساد می کنند.»