- نصب و عزل و قبول استعفاى فرمانده كلّ سپاه پاسداران انقلاب اسلامى.
- نصب و عزل و قبول استعفاى فرمانده هان عالى نيروهاى نظامى و انتظامى.
- امضاى حكم رياست جمهورى پس از انتخاب از سوى مردم.
- عزل رئيس جمهور پس از رأى عدم كفايت مجلس شوراى اسلامى و يا احراز- تخّلف رياست جمهورى از وظايف قانونى خود بر اساس نظر ديوان عالى كشور.
تأييد مصوّبات شوراى عالى‌ آشنايى با نظام سياسى اسلام ٩٨ اصول انتخابات رياست جمهورى ص : ٩٧ امنيّت ملى. «١» ب- قوّه مقّننه: چند مورد از اختيارات و وظايف رهبرى در قوّه مقّننه عبارتند از:
- نصب و عزل و قبول استعفاى فقهاى شوراى نگهبان.
- فرمان همه پرسى: طبق اصل ٥٩ قانون اساسى، مسائل بسيار مهّم اقتصادى، سياسى، اجتماعى و فرهنگى كشور بايد از راه همه پرسى و مراجعه مستقيم به رأى مردم حل و فصل گردد. در خواست مراجعه به آراى مردم بايد به تصويب ٢٣ مجموع نمايندگان مجلس شوراى اسلامى برسد. اما اين به معناى آن نيست همه پرسى اجرا شود. زيرا فرمان اجراى همه پرسى طبق اصل ١١٠ قانون اساسى از جمله وظايف رهبر است.
ج- قوّه قضائيه: وظايف و اختيارات رهبر در قوّه قضائيه عبارتند از:
- نصب، عزل و قبول استعفاى عالى‌ترين مقام قوّه قضاييه.
- عفو يا تخفيف مجازات محكومين در حدود موازين اسلامى پس از پيشنهاد قوّه قضاييه. «٢» ٣- وظايف و اختيارات رهبر در ديگر سازمان‌ها و نهادها افزون بر وظايف و اختيارات رهبر در سياستهاى كلّى نظام و قواى سه گانه، برخى از سازمان‌ها و نهادهاى جمهورى اسلامى ايران با دستور رهبر تشكيل مى‌شوند و يا رئيس آن‌ها توسط او منصوب مى‌گردد؛ مانند آنچه در زير مى‌آيد:
١- عزل، نصب و قبول استعفاى رئيس سازمان صدا و سيماى جمهورى اسلامى بر عهده رهبر است. «٣»