بسيارى از كسانى كه در فاجعه كربلا نقش داشتند ، در قيام مختار ، دستگير و اعدام شدند . يعقوبى ، در اين باره مى نويسد : مختار ، قاتلان حسين عليه السلام را تعقيب كرد و جمع فراوانى از آنها را كُشت ، به گونه اى كه كم تر كسى از آنها زنده ماند . [١] بر پايه گزارشى كه در بحار الأنوار آمده است، مختار در طول هجده ماه حكومت خود بر كوفه ، هجده هزار تن از كسانى را كه در به شهادت رساندن امام حسين عليه السلام و يارانش شركت كرده بودند ، كُشت ؛ [٢] ليكن اين گزارش ، بسيار اغراق آميز است .همچنين گزارش هايى كه در چگونگى كيفرِ شمارى از مجرمان توسّط مختار در برخى از منابع تاريخى آمده اند و بيانگر كارهايى (مانند : مُثله كردن و در روغن جوشان انداختن) هستند كه در اسلام ، ممنوع اند ، مبالغه آميزند و احتمالاً به وسيله دشمنان مختار ، براى مخدوش جلوه دادن قيام او ساخته شده اند و يا توسّط هوادارانش ، جهت ايجاد هراس و وحشت در دل دشمنان او .

[١] تاريخ اليعقوبى :ج ٢ ص ٢٥٩ .[٢] بحار الأنوار : ج ٤٥ ص ٣٨٦ .