١- النسخة المحفوظة في مكتبة آية اللَّه السيد أحمد الزنجاني، و هي من بداية الكتاب إلى آخر صلاة العيدين، كتبها بخط النسخ تلميذ المصنف و أخو زوجة الشهيد الثاني الشيخ إبراهيم بن علي بن عبد العالي الميسي سنة ٩٣٤ ه‌، و عليها حواشي لطف اللَّه الميسي، تقع النسخة في ٣٤١ ورقة، كلّ ورقة تحتوي على ٢٥ سطرا، بحجم ٢٦ ١٨، و رمزنا لها في هامش الكتاب بالحرف «ح».

٢- النسخة المحفوظة في مكتبة مسجد أعظم في قم المشرفة، تحت رقم ١٣٣٦، تحتوي على كتابي الطهارة و الصلاة، مجهولة الناسخ، و غير واضحة التأريخ، يوجد في الورقة الأخيرة منها تاريخ ٩١٥ ه‌، و يستبعد صحته، لأن المؤلف انتهى من كتابة كتابه إلى آخر صلاة العيدين في سنة ٩٢١ ه‌، و تتصف هذه النسخة بعبارتها المضبوطة و دقّتها، و قد وردت في حاشيتها عدّة عبارات و تعليقات ختمت بجملة «منه مدّ ظلّه» ممّا يدلّ على أنّها مقروءة أو منقولة من نسخة الأصل، و جعلت هذه النسخة أصلا في ضبط النص، و رمزنا لها في هامش الكتاب بالحرف «ع».

٣- النسخة المحفوظة في مكتبة مدرسة سليمان خان في مشهد المقدسة، و هي من كتاب الحيض إلى كتاب الأمر بالمعروف، كتبها بخط نسخي قريب من النستعليق محمد بن علي بن محمد الحسيني بتاريخ ٩٦٩ ه‌، تقع النسخة في ٣٨٣ ورقة، كلّ ورقة تحتوي على ٢٥ سطرا، و رمزنا لها في هامش الكتاب بالحرف «ن». انظر: «فهرس النسخ الخطية لأربع مكتبات في مشهد ص ٨».

٤- النسخة المحفوظة في مكتبة سپهسالار تحت رقم ٢٥٣٨، و هي من صلاة الكسوف إلى أوائل المتاجر، مجهولة التاريخ، كتبت بخط النستعليق غير منقّط، و احتمل مفهرس المكتبة كونها بخط المؤلف، و عند مقابلتها ظهر فيها بعض الأخطاء ممّا يدلّ على أنّها ليست بخط المؤلّف، تقع هذه النسخة في ١٠٤ أوراق،