ليكن مشاهده مى‌كنيم كه اديان تحريف شده‌اى چون مسيحيت به نام دين در پى سلب آزادى انسانها بر مى‌آيند و باعث دلسردى آنان از دين و خدا مى‌شوند.
ديوان تفتيش عقايد، نام دادگاهى بود كه دربار پاپ براى نابودى مخالفان خود برپا نمود و در دوران حكومت خود فجايع عظيمى را مرتكب گرديد. در ابتدا با كسانى كه از آيين «كاتوليك» روى بر مى‌تافتند، مبارزه مى‌كرد و آنان را مى‌سوزاند و مى‌كشت، ولى به تدريج به صورت اختناق علوم درآمد و با هر نوع پيشرفت علمى مخالف با نظرات و افكار پيشينيان، سرسختانه پيكار كرد. حتى روزى كه متفكر ايتاليايى «ژيودانوبرونو» به احياى نظريه دانشمند بزرگ «فيثاغورث» برخاست و به خلاف نظريه «بطليموس» «١» حركت زمين و سيارات ديگر را بر گرد خورشيد، ثابت نمود، به همين جرم، در محكمه تفتيش عقايد، در كاخ واتيكان محاكمه شد و با رأى بى اساس، محكوم به ارتداد گرديد و اگر شفاعت و ميانجيگرى يكى از افراد مؤثر آن روز نبود و توبه خود را از اعتقاد به حركت زمين نمى‌نوشت، به سرنوشت سايرين دچار مى‌گرديد. بدين خاطر بود كه دانشمندان و محققان جرأت نداشتند بر خلاف كليسا بينديشند. اين فشار شديد بر انديشه‌ها كه از قرن دوازدهم تا نوزدهم در كشورهاى فرانسه، انگلستان، آلمان، هلند، پرتقال، لهستان و اسپانيا حاكم بود، در نتيجه، واكنش بسيار بدى نسبت به دين و مذهب ايجاد نمود.
تعداد قربانيان اين سازمان ننگين ضد علم و انسانيت از سال ١٤٨٠ تا ١٨٠٨ بالغ بر ٣١٩١٢ تن سوخته و ٢٩١٤٥٠ تن محكوم به مجازاتهاى سنگين تخمين زده مى‌شود «٢».
اين گونه اعمال وحشيانه تشكيلات مذهبى مسيحيت با دانشمندان و ساير طبقات، بذر عناد و دشمنى را در دلها پاشيد و آنان را نه تنها نسبت به مسيحيت بدبين نمود، بلكه در بيشتر مردم، روح انزجار و نفرت نسبت به اصل دين و مذهب را پديد آورد.