مهم‌تر از همه نافرمانى از رهبر انقلاب اسلامى امام خمينى (ره)، سازمان مجاهدين خلق (منافقين) را به سرنوشت شومى درانداخت كه بسيارى از اعضاى آن، در آغاز، حتى گمان چنين سرنوشتى را نمى‌بردند.
از جمله مطالبى كه نبايد فرو گذاشت، فساد اخلاقى درون سازمان منافقين پس از تأسيس آن است. آنان به دليل افكار ماركسيستى و التقاطى، بى قيدى و عدم تعبد به دستورات اسلامى، خانه‌هاى تيمى خود را به مراكز فساد و فحشاء تبديل كرده بودند و يا اينكه دور از چشم ساير اعضاء به روابط نامشروع خود ادامه مى‌دادند. برخى از اعضاى منافقين در بازجويى‌هاى خود به اين امر اعتراف كرده‌اند كه قلم از ذكر آن شرمگين است. «١» فساد اخلاقى سازمان چه قبل و بعد از پيروزى انقلاب تداوم داشته است. از جمله مى‌توان به فساد تقى شهرام و وحيد افراخته اشاره كرد. وحيد افراخته كه بعداً اعدام شد يكى از عناصر زن باره سازمان بود كه زنان و دختران زيادى را به دام فساد خود و سازمان كشانيد. «٢» سازمان حتى به زنان شوهردار و فرزندان آنها نيز با توجيه مقتضيات سازمانى رحم نكرد. از جمله مى‌توان به ازدواج نامشروع مسعود رجوى رهبر منافقين با مريم قجر عضدانلو زن ابريشم‌چى اشاره كرد.
٣- ٤- ٥. گروه فرقان‌ اين گروه از جمله تشكلهاى داراى تفكر التقاطى بود. تفكر التقاطى چنانكه گذشت انديشه‌اى است كه از نظر ايدئولوژيك تركيبى از چند مكتب فكرى است؛ مثلًا دو مكتب مانند اسلام و ماركسيسم (چنان كه در افكار مجاهدين‌