خسروشاهى، صدر بلاغى، سيد غلامرضا سعيدى، امير تيمور كلالى، شهاب فردوس، هاشم شبسترى زاده، كريم انصارين و اشرف مهاجر از حزب استعفا دادند و به نوعى توقف فعاليت حزب را اعلام كردند امّا جمعى از جمله دكتر عليزاده، حسين منتظر حقيقى و حسين بشارت بر ادامه حيات حزب تأكيد كردند. «١» مخالف با شركت در انتخابات خبرگان قانون اساسى كه على رغم آن شاخه تبريز شركت كرد، مخالفت با تصويب اصل ولايت فقيه توسط نمايندگان حزب در مجلس خبرگان، مخالفت با همه پرسى قانون اساسى، مخالفت با امام خمينى و رهبران حزب جمهورى اسلامى، اختلاف‌افكنى و ايجاد آشوب در تبريز، قم، اروميه و اردبيل به بهانه دفاع از شريعتمدارى و در پى قتل مشكوك يك نگهبان منزل شريعتمدارى از جمله عملكرد حزب خلق مسلمان است.
در پى اقدامات ضد انقلابى هواداران حزب، بويژه اغتشاش در شهر تبريز و به دست‌گيرى راديو، تلويزيون و ادارات دولتى تعدادى از عوامل آشوب توسط دادگاه انقلاب تبريز اعدام شدند و با آشكار شدن ماهيت ضد انقلابى حزب براى مردم، مسلمانان غيور آذربايجان و مردم انقلابى مناطق ديگر به مخالفت با حزب خلق مسلمان برخاسته و در نهايت، اين حزب منحل شد. «٢» پايگاه عمده فعاليت حزب خلق مسلمان، آذربايجان و ارگان حزب، روزنامه «خلق مسلمان» نام داشت. «٣» دفتر هماهنگى بنى‌صدر اعضاى اين دفتر را طرفداران ابوالحسن بنى‌صدر اولين رئيس جمهور ايران در سال ١٣٥٨ تشكيل مى‌دادند كه به حمايت از او در كشور فعاليت مى‌كردند.