صحيفه امام - الخميني، السيد روح الله - الصفحة ٤٦ - پيام به ملت ايران به مناسبت سالگرد پيروزى انقلاب (بيان موقعيت ايران)
لكن عمل مثبتى درباره آن انجام نگرفته، ايجاد نظم و انضباط در حوزههاست، كه لازم است از حوزه علميه قم شروع شود و به طور جدى و اساسى عمل شود. البته اين امر براى حفظ حوزهها از ورود عناصر منحرف از حيث عقايد و اخلاق و اعمال از اهم وظايف شرعى است، كه به عهده همه خصوصاً فضلا و علما و مدرسين مىباشد؛ و با همكارى جدى همگان و با تأييد مراجع معظّم مىتواند جامه عمل پوشد. در اين زمان كه حوزههاى علميه و روحانيون معظّم در پيشبرد مقاصد اسلام و تحكيم جمهورى اسلامى نقش بسيار مؤثرى دارند، شك نيست كه قدرتمندان و قدرت طلبان بيكار ننشستهاند، بلكه در تلاشند تا اين قدرت فعال را تضعيف كنند. و اين امر براى آنان ميسر نيست مگر با رخنه كردن عناصر فاسد در حوزهها، كه از داخل موجبات تباهى و از كار افتادن اين پديده الهى را فراهم آورده، و خداى نخواسته به تدريج و در دراز مدت ملت را از آنها مأيوس و روى گردان كنند. و همه مىدانيم كه اگر خداى نخواسته حوزهها از عهده تربيت فقها و علما و خطباى موجه و مورد علاقه مردم برنيايند و به طور هرج و مرج و بدون برنامه صحيح و ضابطه اسلامى عقلايى حوزهها اداره شوند، بايد همه منتظر فاجعه شكست جمهورى اسلامى و اسلام بزرگ باشيم. و اگر اكنون با همت همگان از سرچشمه فساد جلوگيرى نشود، فردا و فرداها دير است، و بسا باشد كه به جايى رسد كه از قدرت همه خارج شود و مقايسه امروز حوزهها با قبل از انقلاب، كه روحانيون از سياست و نظر در امور كشور به واسطه تبليغات و فشارها و كجفهميها منعزل و بركنار بودند، بسيار نابجا و غلط است. گرچه ممكن است بعضى كج فهمها با اين امر حياتى مخالف باشند و با تز «نظم در بىنظمى است» با توهّمات شيطانى دست به گريبان باشند، لكن اينان در اقليت هستند؛ و قشرهاى عظيم روحانيون متفكر و متوجه به مسائل و پيشامدها در اين فكر هستند. و بالاخره همان طور كه پاكسازى و تصفيه در همه ارگانهاى دولتى و كشورى و لشكرى لازم است، در حوزهها و دانشگاهها، كه همگام با حوزهها هستند و هر دو از ويژگى خاصى برخوردارند، تصفيه و پاكسازى مهمتر است. و با تصفيه اين دو پايگاه اسلامى و ملى، محتواى جمهورى اسلامى به رشد و ترقى خود ادامه خواهد داد. و با انحراف اين دو،