طرف اكثريت قاطع مردم به مرجعيّت و رهبرى شناخته و پذيرفته شدند تعيين رهبر به عهده خبرگان منتخب مردم است.
خبرگان رهبرى درباره فقهاى واجد شرايط مذكور در اصول پنجم و يكصد و نهم بررسى و مشورت مى‌كنند، هرگاه يكى از آنان را اعلم به احكام و موضوعات فقهى يا مسائل سياسى و اجتماعى يا داراى مقبوليت عامه يا واجد برجستگى خاص در يكى از صفات مذكور در اصل يكصد و نهم تشخيص دهند، او را به رهبرى انتخاب مى‌كنند و در غير اين صورت، يكى از آنان‌را به‌عنوان رهبر انتخاب و معرفى مى‌نمايند. رهبر منتخب خبرگان، ولايت امر و همه مسؤوليتهاى ناشى از آن را برعهده خواهد داشت.
در اصل يكصد و يازدهم شرايط و نحوه بركنارى رهبر مطرح و مرجع تشخيص اين امر را، خبرگان منتخب ملت معرفى كرده است و در فاصله‌اى كه بين عزل، كناره‌گيرى يا فوت رهبر و انتخاب رهبر جديد ايجاد مى‌شود، به خاطر جلوگيرى از اخلال و تزلزل در اركان حكومت شورايى مركب از رئيس جمهور، رئيس قوه قضائيه و يك نفر از فقهاى شوراى نگهبان به انتخاب مجمع تشخيص مصلحت نظام، به طور موقت عهده‌دار همه وظايف رهبرى مى‌شوند.
اين شورا در بعضى از وظايف و اختيارات رهبر به‌طور مستقيم اقدام كرده و در برخى موارد، پس از تصويب مجمع تشخيص مصلحت عمل مى‌نمايد.
همچنين در مواقعى كه رهبر بر اثر بيمارى يا حادثه ديگرى به طور موقت قادر به انجام وظايف رهبرى نباشد، شوراى مذكور عهده‌دار وظايف او خواهد شد.