پهلوى برنداشت و در تماس با مردم محروم آن ديار، ضمن بيان معارف قرآنى، نقش مهمى در توجه دادن مردم به امام و روحانيون ايفا كرد.
در آن سال كه جارى شدن سيل باعث بى‌خانمان شدن و خسارت ديدن افراد زيادى از مردم گرديد، ايشان با استفاده از تجربه «فردوس و گناباد» گروهى از طلاب و روحانيون را بسيج كرد و به كمك مردم شتافت؛ بطورى كه نقش فعال ايشان در اين زمينه، موجب ترس و وحشت ساواك و نيز تعجب آنان گرديد. در اين باره، رئيس ساواك به ايشان مى‌گويد:
ديشب در كميسيون امنيت شهربانى به ساواك گفتم شما چقدر بى‌عرضه هستيد كه هيچ كارى نكرده‌ايد. يك تبعيدى ببينيد اينجا چه اوضاعى درست كرده! «١» اما پس از گذشت يك سال (در سال ٥٧) با اوج‌گيرى انقلاب اسلامى و ناتوان شدن رژيم از كنترل كشور، آيةالله العظمى خامنه‌اى به مشهد بازگشت و تا سرنگونى رژيم و پيروزى كامل انقلاب به تلاشهاى مجدّانه خويش در راه احياى ارزشهاى اسلام و انقلاب ادامه داد.
عضويت در شوراى انقلاب؛ بى‌شك يكى از مهمترين اركانى كه در پيروزى انقلاب اسلامى و اداره آن پس از پيروزى نقش اساسى داشته است، شوراى انقلاب است كه به فرمان بنيانگذار جمهورى اسلامى ايران حضرت امام خمينى قدس سره تشكيل گرديد تا بتواند اداره حكومت آينده را به دست گيرد. حجةالاسلام هاشمى رفسنجانى، در اين باره مى‌گويد:
هنگامى كه امام پاريس بودند، ٥- ٦ نفر را معين كرده بودند كه بنشينند و