كمى پس از موافقت با مشروطيت، به سلطنت رسيد. او سوگند ياد كرده بود كه با مشروطيت مخالفت نكند و مجلس را منحل نسازد؛ اما پس از مدت كوتاهى به كمك عوامل و نيروهاى روسى، با مردم و مجلس به جنگ پرداخت و اقدامى كم‌نظير در تاريخ سياسى جهان انجام داد. او مشيرالدوله را كه در تشكيل مجلس موقت و مجلس اول، تدوين قانون اساسى و تشكيل اولين دولت پس از مشروطه شركت داشت عزل كرد و ميرزا على‌اصغرخان اتابك را از اروپا فرا خواند و به صدارت نشاند.

امين‌السلطان به شدت مورد تنفر و انزجار مردم بود و مردم مانع ورود وى به ايران بودند.

وى سوگند ياد كرد كه به مشروطيت وفادار خواهد بود، اما مدت كوتاهى بعد از صدارت، به‌دست شخصى به نام عباس‌آقا صراف تبريزى در نهم شهريور ١٢٨٦ مقابل مجلس شوراى ملى با گلوله كشته شد. با قتل اتابك، محمدعلى شاه مجلس را منحل كرد. عده بسيارى از مردم دستگير و روزنامه‌ها تعطيل شدند. ناصرالملك، صدراعظم و اميربهادر، فرمانده كل قوا شد.

در دوم تير ١٢٨٧ در حالى كه نمايندگان در مجلس مشغول بحث درباره اوضاع كشور بودند، سربازان روس مجلس را محاصره و آن را به توپ بستند. شمارى از نمايندگان كشته و تعدادى دستگير شدند. چند تن از مبارزان مشروطيت، از جمله سيدجمال‌الدين واعظ اصفهانى، اعدام و تعدادى از علما تبعيد و عده‌اى به سفارت انگليس پناهنده شدند.

دربار قاجار و سفارت روسيه، مردم را مرعوب و تسليم‌شده و مشروطيت را پايان يافته دانستند، اما با گسترش نهضت و موج ضداستبدادى و حركت مردمى در بيشتر ولايات و با وجود سركوب شديد و رفتارهاى بسيار خشن، سرانجام در ٢٢ تير ١٢٨٨ نيروهاى طرفدار مشروطه در تهران گردهم آمدند و در ٢٤ تير، تهران فتح و قزاقان روسى به فرماندهى كلنل لياخوف با شرمندگى تسليم شدند.

در ٢٥ تير، محمدعلى شاه و شمارى از خاندان قاجار و مقامات لشگرى و كشورى به سفارت روس و شمار بسيارى از دولتى‌ها نيز به ديگر سفارتخانه‌هاى بيگانه پناهنده شدند.

سفارتخانه‌هاى روس و انگليس براى تعدادى از متصديان امور دولتى پرچم فرستادند تا بر