ومن أجل هذا الهدف ارتأت المؤسّسة عقد مؤتمر علمي تدعو فيه العلماء وأهل الرأي والنظر في الاُمور الفقهية لبحث ومناقشة مختلف الجوانب العلمية والفنّية لهذا المشروع الجبّار ، واقتراح الحلول للمشكلات والصعوبات التي تعترضه ، وإرساء قواعد المنهج الذي ينبغي تدوين الموسوعة على طبقه .

وإيماناً بضرورة مشاركة أصحاب الاختصاص وذوي الخبرة في العلوم الفقهيّة والتأليف الموسوعي في إرساء قواعد المنهج العلمي السليم لمشروع تدوين دائرة معارف فقهيّة عصرية جامعة تعكس بصورة دقيقة ، وبطريقة ميسّرة ، التراث الفقهي العظيم المذخور في مؤلّفات علماء مدرسة أهل البيت (عليهم ‌السلام) وتجعله في متناول الراغبين في الاطّلاع عليه والإفادة منه . ومن أجل دراسة الخيارات المنهجية التي أفرزتها التجارب الموسوعية الحديثة في العالم الإسلامي ، وبحث مختلف القضايا والمشكلات العلمية والمنهجية التي يواجهها العمل الموسوعي الفقهي الذي تكوّنت من أجل الإعداد له وتنفيذه مؤسّسة دائرة معارف الفقه الإسلامي بأمر من ولي أمر المسلمين قائد الجمهورية الإسلامية المعظّم آية اللّه‌ السيد علي الخامنئي (دام ظلّه) سعت هذه المؤسّسة لعقد مؤتمرها العلمي الأوّل تحت شعار : «في سبيل موسوعة فقهيّة حديثة طبقاً لمذهب أهل البيت (عليهم ‌السلام) »في الفترة من الحادي والعشرين إلى الثاني والعشرين من شهر شعبان ١٤١٤هـ ق الموافق للرابع عشر والخامس عشر من بهمن ١٣٧٢هـ . ش ، والثالث والرابع من شباط ١٩٩٤م.

وقد انعقد المؤتمر الأوّل في مدينة قم المقدّسة باعتبارها أكبر مركز للعلوم والمعارف الإسلامية . وشارك في المؤتمر عدد كبير من الفضلاء والعلماء وفي مقدّمتهم كبار الفقهاء والمجتهدين ، وقد دعي إلى المؤتمر أيضاً مجموعة من أساتذة الجامعات والخبراء المتخصّصين ، وأيضاً حضر عدد من كبار المسؤولين في الجمهورية الإسلامية ، وافتتح المؤتمر بتلاوة من آي الذكر الحكيم ، وتُلي بيان