رسالة المسائل الاسطنبولية في الواجبات العينية مذكورة في الرياض ٤٢ رسالة في الاخبار مشتملة على خمسة فصول في الرياض رأيتها ببلدة ساوة اه‌ ولعلها الكتاب الذي فيه نحو ألف حديث الآتي ٤٣ رسالة في دعوى الاجماع في مسائل من الشيخ ومخالفة نفسه ٤٤ رسالة في ذكر أحواله وهي التي نقل عنها ابن العودي ٤٥ منية المريد في آداب المفيد والمستفيد مشتمل في آداب وفوائد جليلة وهو نعم المهذب لأخلاق الطلاب لمن عمل به طبع مرتين في الهند وإيران ٤٦ بغية المريد مختصر منه وكان ابن العودي اخذ اسم كتابه في ترجمة الشهيد منه ٤٧ نتائج الأفكار في حكم المقيمين في الاسفار ٤٨ كفاية المحتاج في مناسك الحاج وهو المناسك الكبير في الحج والعمرة لطيفة ٥١ مسكن الفوائد عند فقد الأحبة والأولاد لم يسبق إلى مثله وسبب تصنيفه له كثرة ما توفي له من الأولاد بحيث لم يبق منهم أحد الا الشيخ حسن وكان لا يثق بحياته وقد استشهد وهو ابن أربع سنين أو سبع سنين كما مر في ترجمته مطبوع ٥٢ مبرد الأكباد مختصر منه ٥٣ كشف الريبة عن احكام الغيبة لم يسبق إليه مطبوع ٥٤ البداية في علم الدراية ٥٥ شرح البداية مزجي فرع منه ليلة الثلاثاء ٥ ذي الحجة سنة ٩٥٩ مطبوعان معا ٥٦ البداية في سبيل الهداية وهو غير بداية الدراية المتقدم فقد ذكرا معا في أمل الآمل ويعطي اسمه انه في العقائد ٥٧ جواهر الكلمات في شيع العقود والايقاعات في الرياض هو كتاب حسن رأيت منه نسخة في خزانة الحضرة الرضوية ويحتمل اتحاده مع ما سبق في كلام الشيخ المعاصر بعنوان كتاب العقود بل هو الظاهر لكن الحق عندي كونه من مؤلفات غيره وهو الشيخ حسن بن مفلح الصيمري المشهور اه‌ ورأى صاحب الذريعة نسخة صيغ العقود وليس فيها التسمية بجواهر الكلمات وقد وقع خلل في كلام صاحب الرياض فان عادته ان يعبر بالشيخ المعاصر عن صاحب أمل الآمل وليس في الأمل ذكر لكتاب العقود وانما ذكره صاحب الرياض نفسه ٥٨ منار القاصدين في أسرار معالم الدين ٥٩ غنية القاصدين في اصطلاحات المحدثين ٦٠ كتاب الرجال والنسب ٦١ كتاب تحقيق الاسلام والايمان. وهو كتاب حقائق الايمان الذي رأينا منه نسخة مخطوطة في طهران صرح بذلك صاحب الذريعة ٦٢ كتاب الإجازات قال ولده الشيخ حسن في أواخر اجازته الكبيرة المشهورة ان والدي جمع أكثر إجازات المشايخ في كتاب مفرد ذكره في فهرست كتب خزانته ٦٣ منظومة في النحو وشرحها ٦٤ جوابات مسائل الشيخ زين الدين ولا يعرف من هو هذا الشيخ زين الدين ولعله الفقعاتي شريكه في الدرس ٦٥ جوابات مسائل الشيخ احمد والظاهر أن المراد به الشيخ احمد العاملي الشهير بالمازحي فان له مسائل سال عنها الشهيد الثاني واجابه عنها في الذريعة أكثرها فقهية تاريخ كتابة النسخة ٩٨٠ ٦٦ جوابات المسائل الثلاث الخراسانية ٦٧ جوابات المباحث النجفية ٦٨ جوابات المسائل الهندية ٦٩ جوابات المسائل الشامية ذكرت الأربعة في أمل الآمل ٧٠ جوابات ستين مسالة في الذريعة محذوفة السؤال بعنوان مسالة اقتصر فيها على الجواب فقط وفي آخرها: اعلم أن الشيخ زين الدين الشهيد كتب هذه المسائل في جواب سؤالات وجدتها بخطه لكن تركت السؤالات لمعلوميتها وكتبت الأجوبة لاستقلالها والنسخة بخط شرف الدين علي بن جمال الدين المازندراني الذي كان حيا سنة ١٠٧٠ اه‌ ٧١ مختصر الخلاصة ومر مختصر مسكن الفؤاد ومختصر المناسك ومختصر منية المريد ٧٢ فؤاد خلاصة العلامة في الرجال ولعله حاشية الخلاصة المتقدم ٧٣ إجازة الشيخ حسين بن عبد الصمد وهي إحدى الإجازات الثلاث المشهورات تاريخها ليلة الخميس ٣ جمادى الآخرة سنة ٩٤١ ٧٤ كتاب فيه نحو ألف حديث انتخبها من كتاب المشيخة للحسن بن محبوب رآه صاحب أمل الآمل بخطه ويحتمل كونه المذكور في الرياض بعنوان رسالة في الاخبار مشتملة على خمسة فصول ٧٥ الأربعون حديثا في الفضائل ينقل عنه المولى احمد الأردبيلي في حديقة الشيعة جملة من اخبار فضائل أمير المؤمنين ع ٧٦ آداب الصلاة وهو غير أسرار الصلاة المتقدم ٧٧ أسرار الزكاة والصوم والحج عن كشف الحجب انه استخرجه من جواهر القرآن للغزالي ويمكن كونه منار القاصدين في أسرار معالم الدين المتقدم ٧٨ أنوار الهدى في مسالة البدا ٧٩ الرسالة الاعتقادية في معرفة الله وما يتبعها من الأصول رآها صاحب الذريعة.
ما قاله ولده الشيخ حسن في كتاب المسالك في حاشية الرياض للمؤلف قال ولده الشيخ حسن في مدح كتاب المسالك لوالده:
لولا كتاب مسالك الأفهام * ما بان نهج الشرائع الاسلام كلا ولا كشف الحجاب مؤلف * عن مشكلات غوامض الاحكام قد زينته حقائق ودقائق * خضعت لهن نواصب الافهام وحوت صحائفه نفيس فرائد * قد نظمت بنهاية الاحكام تزهو بهن كمثل أحسن روضة * أزهارها خرجت من الأكمام ان اللسان لعاجز عن نعته * وكذاك تعجز السن الأقلام فجزى مؤلفه الرحيم بجوده * خير الجزا وحباه بالاكرام أشعاره لما زار النبي ص سنة ٩٤٣ ووقف على قبره الشريف بالمدينة المنورة وكان قد رآه ص في منامه بمصر فوعده بالخير أنشأ يقول:
صلاة وتسليم على أشرف الورى * ومن فضله ينبو عن الحد والحصر ومن قد رقى السبع الطباق بنعله * وعوضه الله البراق عن المهر وخاطبه الله العلي بحبه * شفاها ولم يحصل لعبد ولا حر عدولي عن تعداد فضلك لائق * يكل لساني عنه في النظم والنثر وما ذا يقول الناس في مدح من أتت * مدائحه الغراء في محكم الذكر سعيت إليه عاجلا سعي عاجز * بعبئ ذنوب جمة أثقلت ظهري ولكن ريح الشوق حرك همتي * وروح الرجا مع ضعف نفسي ومع فقري ومن عادة العرب الكرام بوفدهم * اعادته بالخير والحبر والوفر وجادوا بلا وعد مضى لنزيلهم * فكيف وقد واعدتني الخير في مصر فحقق رجائي سيدي في زيارتي * بنيل منائي والشفاعة في حشري وقوله:
لقد جاء في القرآن آية حكمة * تدمر آيات الضلال ومن يجبر وتخبر ان الاختيار بأيدنا * فمن شاء فليؤمن ومن شاء فليكفر