عنوان هيأت‌هاى مذهبى، فعاليّت‌هاى سياسى نيز انجام مى‌دهند. ايشان تصميم گرفت كه فعّاليّت آنها را متمركز كرده، به قم وصل كند. از اين رو، نماينده‌اى به تهران فرستاد و از آنها خواست كه به قم بيايند. ابتدا سه هيأت (هيأت مسجد امين‌الدوله، هيأت اصفهانى‌ها و هيأت مسجد شيخ على) را به صورت جداگانه به حضور پذيرفت و يك بار هم هر سه هيأت را به صورت دسته جمعى دعوت كرد و از آنها خواست كه ضمن ارتباط با وى، فعّاليّت خود را در تهران متمركز كنند. اين افراد پس از مراجعت به تهران، با هم متحد شده و گروهى به نام هيأت‌هاى مؤتلفه اسلامى را تشكيل دادند. «١» اركان هيأت‌هاى مؤتلفه اسلامى:
الف) شوراى روحانيت: اين شورا داراى چهار عضو رسمى و دو عضو غير رسمى بود. اعضاى رسمى آن شامل شهيد آيت‌الله مطهرى و شهيد آيت‌الله دكتر بهشتى و حجج اسلام آقايان انوارى و مولائى بودند. دو عضو غير رسمى آن نيز شهيد محمدجواد باهنر و آيت‌الله هاشمى رفسنجانى بودند. «٢» اين افراد در واقع نمايندگان غير رسمى امام (ره) در اين گروه بودند.
اين شورا داراى دو وظيفه مهم ذيل بود:
١- مشاوره و نظارت بر فعّاليّت‌هاى هيأت‌هاى مؤتلفه و انطباق آنها با موازين شرع و خط مشى امام (ره)،