طبقات أعلام الشيعة - ط دار إحياء - الطهراني، آقا بزرك - الصفحة ١٧٤ - فهرس بعض المكتبات المنقول عنها فى الطبقات و الذريعة
حيث انتقل القسم المملوك منها إلى ورثته فى النجف و الموقوفات منها و هى التى وقفها الحاج محمد باقر الشيرازى و غيره انتقلت إلى مكتبة المدرسة الشيرازية بسامراء-و قد يرمز عنها «المجدد الشيرازى» او «السيد محمد حسن الشيرازى» .
مكتبة الشريعة: هى مكتبة المولى فتح اللّه الشهير بشيخ الشريعة الاصفهانى (١٢٦٦- ١٣٣٩) بالنجف كانت فيها كتب نفيسة بيعت اكثرها بعد وفاته.
مكتبة السيد شهاب الدين بقم: مكتبة شخصية لصاحبه السيد شهاب الدين المرعشى المعروف بآقا نجفى و هو ابن السيد محمود بن شرف الدين على صاحب الحاشية المذكوره فى ذ ٦: ١٦٩. ولد صاحب المكتبة فى النجف فى ٢٠ صفر ١٣١٥ و أسس مكتته هذه عام ١٣٣٥ و جمع فيها ما ينوف على ستة آلاف مجلّد بين مطبوع و مخطوط، و لكنه باع بعضها و تشتمل المكتبة الآن على زهاء ألف مجلّد من المخطوطات كما كتبه إلى و قد رأيت فيها مجموعات نفيسه، و هو ممن يكتب فهرس مكتبه و يرسلها تباعا إلى والدى فى النجف. هذا ما كانت عليه المكتبة عام ١٣٢٥ ش و قد زاد المؤسس عليها اضعاف ذلك ثم وقفها و جعلها بناية عظيمة فى قم و ألّف السيد احمد الاشكورى لها فهرسا بمساعدة السيد محمود المرعشى ابن المؤسس، خرج منه حتى اليوم ثمانية مجلّدات كل منها يحتوى على ٤٠٠ مخطوطة فارسية و عربية. و قد يرمز للمكتبة. «آقا نجفى التبريزى» .
مكتبة شيخ الاسلام بزنجان: و هى مكتبة نفيسة تشتمل على نسخ قيمة جدا أسس هذه المكتبة ظاهرا الآخوند المولى على جدّ أسرة شيخ الاسلام بهذه البلدة فانّه توجد كتب موقوفة باسمه فى ١١٢٩ و بعده انتقلت إلى أولاده و زادوا عليها حتى وصلت اليوم إلى الشيخ فضل اللّه شيخ الاسلام ١٣٠٢-١٣٧٠ بن نصر اللّه بن محمد بن على المذكور [١] .
كتب شيخ العراقين: مكتبة الطهرانى بكربلا.
[١] -و فى سنة... اشترت مكتبة المجلس مخطوطات مكتبة المرحوم شيخ الاسلام الزنجانى رحمه اللّه تمامها او قريبا من تمامها و فيها نفائس قيمه جدا.