حضرت آيتاللّه العظمى حاج سيد محمد رضا گلپايگانى به روايت اسناد ساواك - -- - الصفحة ٨٠
حضرت امام خمينى (رضواناللّه تعالى عليه) نيز در مكاتبات و ديدارهاى مختلف خود با اعضاى جامعه مدرسين حوزه علميه قم، آنها را به تبعيت از نظرات معظم له در اداره امور حوزههاى علميه فرا خواندند.
در اينجا توجه خوانندگان محترم را در خصوص نظر حضرت امام (ره) راجع به اداره حوزه و رسيدگى بهاوضاع درسى و اخلاقى طلاب و تأكيد ايشان بر تبعيت از نظرات آيتاللّه گلپايگانى جلب مىكنيم:
محضر مقدس آيتاللّه العظمى امام خمينى مدظله العالى
پس از سلام همان گونه كه خاطر شريف مستحضر است مدتى پيش حضورا مسائل مربوط به حوزه علميه قم و لزوم ايجاد نظم و رسيدگى به اوضاع درسى و اخلاقى و جريانات داخلى آن به عرض حضرتعالى رسيد و رهنموداتى فرموديد و بنا شد براى انجام اين مسئوليت شورائى از فضلاء مدرسين حوزه علميه قم تشكيل شود بر حسب نظر حضرتعالى و مشورت و نظرخواهى از حضرت آيتاللّه العظمى آقاى گلپايگانى شورايى مركب از آقايان حجج اسلام: راستى، كريمى، طاهرشمسى، دوزدوزانى، صابرى، افتخارى، دامت افاضاتهم تشكيل شد و قدمهاى مؤثرى تا حال برداشتهاند. چنانچه رهنمودهاى جديد داريد مرقوم فرماييد.
اداماللّه ظلكم الشريف- حسينعلى منتظرى
بسمه تعالى
شوراى مزبور كارهايى را كه مىخواهند انجام دهند پس از نظرخواهى در امور مهم از حضرات آيتاللّه گلپايگانى دامت بركاته مانعى ندارد انشاءاللّه موفق باشيد.
روحاللّه الموسوى الخمينى
يكى از مسائلى كه آيتاللّه گلپايگانى بر آن تأكيد بسيار داشتند استقلال حوزه و اداره آنها به شيوه سنتى تحت اشراف مراجع معظم تقليد و عدم وابستگى آن به دولتها و نهادهاى خارج از حوزه بود. ايشان اعتقاد داشتند كه حوزه بايد مستقل و آزاد و سرافراز روى پاى خود به ايستد و به هيچ فرد و گروه و جناحى وابسته نباشد.
حضرت آيتاللّه مكارم شيرازى در اين راستا مىگويد:
«يك هفته قبل از رحلتشان خدمت معظمله رسيديم. عرض كردم طلاب در امر تحصيل جدى