محل اين مسجد در كنار قبرستان ابوطالب در پايين كوه حجون و بعد از پل به طرف حرم در كنار هتل الجزيره قرار گرفته كه اخيرا بازسازى شده است. نامگذارى اين مسجد بنا بر نقلى از روايات، مربوط به سوره جن است. در اين سوره خداوند مى‌فرمايد: جن‌ها آيات الهى را شنيدند و به آن ايمان آوردند. شايد اين آيات در اين محل نازل شده و بعد به نام مسجد جن شهرت يافته است. برخى نيز گفته‌اند: اين محل بيعت جن‌ها با پيامبر اكرم است.

مسجد شجره‌

مسجد شجره از مساجد قديمى شهر مكه است. اين مسجد در كنار كوه و در مقابل مسجد الجن قرار دارد.

در تاريخچه اين مسجد آمده است: درختى در آنجا بوده كه رسول خدا (ص) آن را صدا كرده و درخت از جاى خود حركت نموده و نزد آن حضرت آمده است.

در يكى از روايات آمده است: پيامبر (ص) ركانه‌بن عبد يزيد را به اسلام دعوت كرد و او گفت ايمان نخواهم آورد تا درختى را صدا كنى و آن نزد تو آيد. حضرت رو به درخت كرده، فرمود: به اذن خدا