جزء دوم: مشتمل بر ٥٠ فصل؛ دربردارنده ضروب قياس‌هاى اقترانى (با توجه به اقسام قضيه)، قياس استثنايى و مركب، اثبات اشكال، اقسام استدلال (استقراء، تمثيل، ضمير، فراست و ....) و بالاخره تحليل قضايا جهت مقدمه برهان.

جزء سوم: مشتمل بر ٣٨ فصل؛ دربردارنده مباحث برهان از صناعات خمس.

طبيعيات بخش طبيعى نجاة مشتمل بر شش مقاله است كه از جزء چهارم تا جزء هفتم كتاب است. [١] مقاله اول: مشتمل بر يك مقدمه و دو فصل، در تبيين موضوع علم طبيعى، مبادى علم طبيعى و جوهريت اجسام.

مقاله دوم: مشتمل بر ١٤ فصل، در بيان لواحق اجسام طبيعى (بحث حركت، زمان، مكان و تناهى ابعاد و جهات) مقاله سوم: مشتمل بر ٨ فصل، در بيان امور طبيعى و غير طبيعى اجسام.

مقاله چهارم: مشتمل بر ٦ فصل، در بيان اجسام اولى مقاله پنجم: در بيان مركبات مقاله ششم: مشتمل بر ١٦ فصل، در مباحث نفس‌

[١] . اجزاء اين بخش بر خلاف بخش منطق صرفا جزوه‌هاى تفكيكى در نگارش كتاب محسوب مى‌شود.