وحسين المعلم، وحمزة الزيات، ورشدين بن كريب مولى ابن عباس، وزكريا بن أبى زائدة، وسعيد بن أبى عروبة، وسفيان الثورى، والأعمش، وشعبة، وعبد الله بن سعيد ابن أبى هند، وعبد الله بن عون، وعبد الرحمن الأوزاعى، وعبد العزيز بن عمر بن عبد العزيز، وعبد الملك بن جريح، وعوف الأعرابى، ومالك بن أنس، ومحمد بن إسحاق ابن يسار، ومحمد بن عبد الرحمن بن أبى ليلى، ومعمر بن راشد، وهشام بن عروة، ويحيى بن سعيد الأنصارى، وأبيه يونس بن أبى إسحاق، وآخرين كثيرين جدًا.
روى عنه أحمد بن جناب المصيصى، وأحمد بن أبى شعيب الحرانى، وإسحاق بن راهويه، وحماد بن سلمة، وهو أكبر منه، والخليل بن عمرو البغوى، وسفيان بن وكيع، وسليمان بن عبد الرحمن الدمشقى، وأبو بكر بن أبى شيبة، وعبد الله بن محمد النفيلى، وعبد الله بن مسلمة القعنبى، وعبد الله بن يوسف التنيسى، وأبو مسهر، وعبد الوهاب ابن نجدة الخوطى، وعلى بن المدينى، وابنه عمرو بن عيسى بن يونس، وعمرو بن محمد الناقد، ومحمد بن سليمان لوين، ومسدد بن مسرهد، ومهدى بن حفص، ونصر بن على الجهضمى، والوليد بن مسلم، وهو من أقرانه، ويحيى بن أكثم القاضى، ويحيى بن معين، وأبوه يونس بن أبى إسحاق، وآخرون كثيرون جدًا.
قلت: روى عيسى بن يونس هذا عن أبى حنيفة الإمام كثيرًا، وروى له مناقب، وذكره أصحابنا من جملة الأئمة الحنفية فى طبقاتهم. وقال أحمد، وأبو حاتم، ويعقوب بن شيبة، والنسائى، وابن خراش: ثقة. وقال حرب بن إسماعيل: سُئل على بن المدينى عن عيسى بن يونس، قال: بخ بخ ثقة مأمون. وقال محمد بن عبد الله بن عمار الموصلى: عيسى بن يونس، وإسرائيل بن يونس، ويوسف بن يونس، هؤلاء أخوة أثبتهم عيسى، ثم يوسف، وهو أثبت من إسرائيل، ثم إسرائيل. وعنه: عيسى حجة، وهو أثبت من إسرائيل. وقال العجلى: كوفى ثقة، وكان يسكن الثغر، وكان ثبتًا فى الحديث. وذكره المزى بإسناده إلى جعفر بن يحيى بن خالد، قال: ما رأينا فى القراء مثل عيسى بن يونس، أرسلنا إليه فأتانا بالرقة، فاعتل قبل أن يرجع، فقلت له: يا أبا عمرو، قد أمرنا لك عشرة آلاف، فقال: هبة؟ فقلت: هى خمسون ألفًا، قال: لا حاجة لى فيها، فقلت: ولم؟ أما والله لأهبنكها، هى والله مائة ألف، قال: لا والله لا يتحدث أهل العلم أنى أكلت للسُّنة ثمنًا، إلا كان هذا قبل أن ترسلوا إلىَّ، فأما على الحديث فلا، ولا شربة ماء، ولا هليلجة. وقال أبو بكر بن أبى خيثمة، عن أحمد بن جناب المصيصى: مات سنة سبع وثمانين ومائة، وقد غزا خمسًا وأربعين غزوة وخمسًا وأربعين حجة. وزاد غيره: فى النصف من شعبان. وزاد محمد بن سعد: بالحدث فى خلافة هارون، وقال: كان ثقة