بزم معرفت: مشاهیر تخت فولاد اصفهان - قاسمی، رحیم - الصفحة ٨٢ - تألیفات
١٣. حدوث دهری و ابطال زمان موهوم
این رساله با راهنمایی استاد سیّد جلال الدین آشتیانی و توسط آقای اصغر ترابی به عنوان پایان نامه در دانشگاه فردوسی مشهد تصحیح و سپس در "منتخباتی از آثار حکمای الهی ایران" چاپ شده است.
جناب حجه الاسلام دکتر سیّد احمد تویسرکانی نیز آن را تصحیح کرده که در مجموعه "سبع رسائل" چاپ شده است.
آقای محمّد نوری در مقاله ای با عنوان: "ملّا اسماعیل خواجویی و نقادی آرای آقا جمال خوانساری" به تحلیل این اثر پرداخته که در مجله "آینه پژوهش" چاپ شده است. عالم جلیل شیخ محمد بن محمد زمان کاشانی از معاصران محقق خواجوئی نیز رساله ای در موضوع فوق با نام "مرآه الازمان فیما اشتبه من امر الزمان علی بعض الاعیان" نگاشته است که اخیرا به چاپ رسیده است.
١٤. هدایه الفؤاد الی نبذ من احوال المعاد
این اثر پرارج که به درخواست "صدیق رفیق و اخ شفیق، مولانا محمّد سعید" در مدّت دو ماه شعبان و رمضان از سال ١١٤٦ق نگاشته شده، بر اساس نسخه اصل به خط مبارک مؤلّف که آقای عبدالحمید مولوی به دانشکده الهیات مشهد هدیه کرده در جلد چهارم "منتخباتی از آثار حکمای الهی ایران" به چاپ رسیده است.
١٥. تبصره الاخوان فی بیان اکبریّه القرآن
در بیان افضل بودن قرآن کریم بر امامان معصوم علیهم السلام.[١]
[١] ١٠٢. علّامه طهرانی می نویسد: رساله فی الثقلین والتکلم فی تعیین الأکبر منهما للسید صدر الدین بن محمّد باقر الرضوی القمی المجاز من الأمیر محمّد حسین الخاتون آبادی والمولی أبی الحسن الشریف، وقد وقع بینه وبین المولی إسماعیل الخاجوئی مراسلات فی تعیین الأکبر منهما. قال السید عبد اللّه الجزائری فی اجازته الکبیره: ناولنی السید الرساله فمنعته عن الغور فی هذه المسأله، فاستحسن کلامی وقال سأغمسها بالماء. الذریعه ج ١١ ص ١٦٠.