فوت استاد، تقريرات اصول ايشان در صيدا چاپ شده است.
آيت الله خويى گذشته از مقام فقاهت، در اصول هم تخصص و تبحرى دارند و امروز از مدرسين بزرگ و نوابغ اين فن به شمار مى‌روند. در علم كلام و معارف قرآن و عقايد اصولى و ردّ ماديين و طبيعيين و مذاهب باطله بزرگترين شاگرد علامه بلاغى (قدّس سره) مى‌باشند.
در حكت الهى و فلسفه از مبرزترين شاگردان آسيد حسين حكيم بادكوبه‌اى و علامه كمپانى و علامه بلاغى مى‌باشد.
در ادب و ادبيات، در هيئت و حساب و هندسه و نجوم و رياضيات، اساتيد فن را درك كرده‌و از غالب علوم و فنون اسلامى بهره كافى گرفته‌اند.
آيت الله خويى تا سال ١٣٥٠ ق به تدريس سطح اشتغال داشته و از آن پس به تدريس خارج پرداخته و در مدت بيست سال چهار دوره اصول تدريس كرده‌اند و در هر دوره گروهى از فضلاى دانشگاه نجف اشرف از منبع فيوضات علمى ايشان سيراب شده و تقريرات درس معظم له را نوشته‌اند. در اين مدّت چها دوره تقريرات ايشان نگاشته شده، چاپ خورده مانند فروع علم اجمالى، مباحث عقليه، جبر و تفويض و غيره.
مكتب و آموزشگاه علمى آيت الله خويى از بهترين حوزه‌هاى علمى نجف اشرف است، در اين مكتب تعليمى علم و دانش را با فضيلت و اخلاق به هم آميخته و آموخته‌اند و لذا طلّاب علوم دينييه با كمال ميل و اشتياق تام به حوزه درس ايشان مى‌شتابند.
آيت الله خويى روزى چهار درس خارج مى‌گويند و در تمام اوقات شبانه‌