غريبانه و مظلومانه و بدون تشييع، پس از نماز توسط حضرت آيت الله حاج سيد على سيستانى وسيله چند تن از خويشانش در مسجد خضراء سر به تيره تراب سپرد.
انتشار اين خبر موجب برقرارى حكومت نظامى در نجف و كوفه و آماده باش نيروهاى نظامى در بغداد، شهرهاى مركزى و جنوبى عراق و منع گرد همائى در اين دو شهر و تفتيش افراد و اتومبيل‌ها شده و مأموران حكومتى در نقاط ورودى اين دو شهر و اطراف صحن حضرت على (عليه السّلام) و منزل ايشان در كوفه مستقر شدند و از برگزارى هرگونه مجلس يادبود و گرامى داشت از سوى بيت و مقلّدين و وكلاى ايشان جلوگيرى شد.
اما در ايران، از نخستين ساعات بامداد روز نهم صفر صداى قرآن از راديو و مأذنه‌هاى حسينيّه‌ها و مساجد پخش و از سوى دولت جمهورى اسلامى سه روز عزاى عمومى اعلام شد، و تمام در و ديوار شهر و روستاها سياه پوش گرديد، و مردم به نوحه خوانى و عزادارى پرداختند.
از سوى رهبر انقلاب، مراجع تقليد و علماى اعلام، رؤساى قواى مجريه، مقننه و قضائيه شخصيّت‌ها، نهادها، سازمان‌ها، انجمن‌هاى اسلامى، هيئت‌هاى مذهبى، پيام‌هاى تسليت صادر و مجالس بزرگداشت بسيار برگزار گرديد.
همچنين شعرا به مرثيه سرايى و خطبا به سخنرانى در عظمت مقام علمى و عملى مرجع تقليد فقيد پرداخته و در كشورهاى مختلف جهان (از هند و كشمير و افغان و پاكستان و بنگلادش و كويت و سوريه و لبنان و امارات خليج فارس گرفته تا آمريكا و كانادا و انگليس) محافل يادبود مختلفى برگزار شد.[١]

[١] . ماده تاريخ فوت ايشان چنين است «إن ابالقاسم حىّ» ١٤١٣.