عشر شهر محمر الحرام سنة ١٢٠٣ من الهجرة في محروسة إصفهان وقد كتبه لى ملا حسين على بن آقازمان في ربيع الثاني سنة ١٢٦٦ وانا محمد كاظم بن الحاج محمد صادق). ثم يبدء كتاب اليقين من الورقة ٨٢ إلى الورقة ١٩٢ وبقي النسخة ناقصة على الباب ١٨١ وبعده أوراق بياض ليس فيها علامات الختم ولا التاريخ). الخامس: نسخة مكتبة آية الله المرعشي قدس سره بقم المقدسمة، رقمها ٦٦٨٢ جاء ذكرها في الملجد ١٧ من فهرس المكتبة ص ٢٤٣، وفيما يلي معربه مختصرا: كتبه بخط النسخ هداية الله بن عناية الله الدزفولي في ١٣٦ ورقة في ٤ رجب ١٠١٦. وقوبل بنسخة اخرى). ويوجد الميكرو فيلم منه في نفس المكتبة. أقول: تحتوي النسخة في أوله بعد الخطبة على فهرس وضعه المؤلف للكتاب في ٢٢ ورقة وإتماما للعمل نورده في هذه الطبعة. السادس: نسخة مكتبة مجلس الشورى القديم بطهران، وهى في مجموعة مخطوطات الطباطبائى برقم ٤٣٢ وولم يطبع الفهرس الذي يتضمن ذكرها. وفيما يلي وصف النسخة: (كتبه بخط النسخ حسين بن محمد الگلپايگانى في يوم الاحد، الرابع من شهر رجب سنة ١٢٨١، وهي في القطع المتوسط ٥ / ١٣ / ٢٢ في ١١٢ ورقة وتتضمن النسخة الفهرس الذي وضعه المؤلف. السابع: أورد العلامة المجلسي أكثر أحاديث كتاب اليقين في (٠ بحار الأنوار)، حتى الأحاديث المذكورة آخر الكتاب بعد الأبواب، وما لم يذكره في البحار إنما هو المتكرر منها في الأغلب. ولذلك استخرجنا منها جميع ما أورده من أحاديث اليقين وكتبنا موضعها من البحار في الهامش، واستقصينا تلك في جميع مجلدات البحار ال‌ ١١٠. وحيث أن النسخة الموجودة من الكتاب عند العلامة المجلسي كان أقدم النسخ الموجودة. أشرنا في الهامش إلى ما اختلف بينها وبين النسخ الأخرى، ورمزنا إليها بكلمة (البحار).