حمايت فداييان اسلام از دكتر مصدّق نيز بر همين اساس استوار بود. در يكى از جلسات كه در منزل يكى از اعضاى فداييان اسلام و با حضور آيت‌ا ... كاشانى، دكتر مصدّق و نواب صفوى تشكيل مى‌شد، فداييان اسلام از مصدّق مى‌پرسند كه اگر شما به حكومت برسيد چگونه عمل خواهيد كرد. وى در پاسخ مى‌گويد هر آنچه كه شما بخواهيد اجرا مى‌كنم. آنها در مقابل اين آمادگى، چنين مى‌گويند كه ما نه مقام مى‌خواهيم و نه مسند بلكه از شما مى‌خواهيم كه احكام اسلام را در اين مملكت پياده كنى، دكتر مصدّق قول مى‌دهد زمانى كه به صدارت رسيد اينچنين كند. «١» بعد از روى كارآمدن مصدّق به وى پيغام مى‌دهند كه شما قول داده بوديد كه حكومت اسلامى را پياده كنيد. دكتر مصدّق در جواب آنها پيغام مى‌دهد كه من آخرين كابينه نخواهم بود. دعوى حكومت اسلامى را براى وقت ديگرى بگذاريد. بطور كلّى نوّاب صفوى علل اختلافات فداييان اسلام و دكتر مصدّق را اينچنين بيان مى‌كند:
١- توافق دكتر مصدّق با شاه، كه نتيجه آن بيرون كردن فدائيان اسلام از صفحه مبارزات بود. ٢- بازشدن پاى آمريكاييان به ايران. ٣- درخواست فداييان اسلام براى اجراى احكام اسلام و زيربار نرفتن دكتر مصدّق. «٢» دستگيرى فداييان اسلام‌ يكى ديگر از مسائلى كه باعث اختلاف بين فداييان اسلام و دكتر مصدّق شد، دستگيرى و زندان كردن عدّه‌اى از اعضاى فداييان اسلام از جمله نوّاب صفوى بود. آنها به علّت اقدامات قهرآميز، همواره تحت تعقيب بودند تا اينكه بالاخره دستگير و زندانى شدند. پس از تحصّن عدّه‌اى از طرفداران فداييان اسلام در زندان و اعتصاب غذاى هفت روزه نوّاب صفوى، سرانجام اعضاى فداييان اسلام و رهبر آنها، نواب صفوى از زندان آزاد مى‌شوند. همسر شهيد نوّاب صفوى مى‌گويد پس از اطلاع از اعتصاب غذاى هفت روزه وى، پدرم به نزد آيت‌الله كاشانى و دكتر مصدّق رفت و به آنها گفت: