وقد تلقت الضربات تلو الضربات وأصبحت من الفرق المحظورة المطاردة من قبل الحكومات مما دفع بها إلى الاتجاه لأوربا ومحاولة نشر أفكارها هناك، وقد أثارت الفرق الأخرى الكثير من الشبهات حول فرقة حزب التحرير وارتباطها بجهات أجنبية، ومنبع هذه الشبهات يعود إلى أفكار هذه الفرقة وتصوراتها ومواقفها وممارساتها التي تتجاوز حدود الأخلاق والآداب والثوابت الشرعية التي هي محل إجماع الفرق الأخرى.

ومن الأمور التي أخذتها الفرق الأخرى على فرقة حزب التحرير وفتحت الباب لإثارة الشبهات من حولها:

ـ التهاون في أمر الصلوات.

ـ القول بإباحة الدخان.

ـ إباحة تقبيل المرأة الأجنبية.

ـ جواز تولي المرأة القضاء.

ـ رفض حديث الآحاد.

ـ تفلت عناصرها وعدم انضباطهم بالهيئة الإسلامية.

ومثل هذه الأمور وغيرها هي التى دفعت بكثير من المسلمين إلى نبذ هذه الفرقة والتشكيك فيها، وهي نفس الأمور التي أدت بهذه الفرقة إلى خسارة الكثير من القواعد في مختلف بلدان المسلمين وحصرتها في النهاية في دائرة ضيقة لتصبح أقل فرق أهل السنة شأناً وحجماً.