چگونگى در گذشت و محلّ دفن او را مخاطب ذكر كرده‌اند؛ در پاره‌اى مآخذ آمده است كه وى به هنگام هجرت به ايران به دست عوامل مأمون به شهادت رسيد. «١» محل دفن او بين اصطخر شيراز، سيرجان، تبريز، رى و قم مردد است. بنابر نقل نجاشى زمانى كه حضرت عبدالعظيم در دى بود پنهانى به زيارت قبرى مى‌رفت- كه هم اكنون در نزديكى قبر اوست- و مى‌گفت: اين قبر مردى از فرزندان موسى بن جعفر ٠ ع) است. «٢» علّامه مجلسى نيز اين احتمال را تقويت كرده است. «٣» ولى صاحب مجدى قبر او را در اصطخر شيراز مى‌داند. «٤» «ابن عنبه» قبرى را كه در شيراز است متعلق به فرزندش «على بن حمزه» مى‌داند و از «لبّ الانساب» نقل مى‌كند كه قبر حمزه در سيرجان است. «٥» در قم نيز مزارى است كه به «شاهزاده حمزه» معروف است و ظاهر سخن صاحب تاريخ قم اين است كه اين بزرگوار همان حمزة بن موسى عليه السلام است. «٦» فاطمه معصومه‌ در ميان دختران موسى بن جعفر عليه السلام فاطمه كبرى معروف به «فاطمه معصومه» عليه السلام از همه برتر، بزرگوارتر و با فضيلت‌تر است. برخى از مورخان چهار نفر از دختران موسى بن جعفر عليه السلام را با نام «فاطمه» ياد كرده‌اند: فاطمه كبرى، فاطمه وسطى، فاطمه صغرى و فاطمه. «٧» فاطمه صغرى، مشهور به «بى بى هيبت» در آذربايج تاريخ زندگانى امام كاظم(ع) ٢٤ در جستجوى برادر ص : ٢٤ ان شوروى در جنوب بادكوبه مدفون است. «٨» فاطمه وسطى- بنا به نقلى- در اصفهان دفن شده است. «٩» قبر