وآخر كتاب نشر له في ليبزغ هو رسالة دفع السموم ومضارها مع ترجمة النص إلى الألمانية، وذلك في سنة ١٩٥٩.
وقد يسر كراوس في المجلد الأول من بحثه العمل، فأحصى جميع المخطوطات الموجودة في شتى مكتبات العالم من مؤلفات جابر، مع الإشارة إلى ما طبع منها.
وليس صحيحا أن الفارابي هو أول صاحب (إحصاء العلوم)، لأن جابر بن حيان - وكان أسبق منه - وضع تصنيفا أدخل فيه العلوم الشرعية إلى جانب العلوم الفلسفية. كما أن الكندي ألف في سائر العلوم، وإنا لنجد ابن النديم في الفهرست يضعها في سبعة عشر قسما، مثل كتبه المنطقيات، والفلكيات، و السياسيات... الخ...
ولم يقصد جابر إلى وضع مؤلف خاص بتقسيم العلوم و إحصائها، ولكنه عرض لهذا الأمر في رسالتين، أحداهما: (رسالة الحدود) أي التعريفات، والأخرى: رسالة (إخراج ما في القوة إلى الفعل). وهو إنما يقسم العلوم بحيث تخدم علم الكيمياء، أو الصنعة، بوجه خاص.
وقال ابن النديم: (أسماء كتبه في الصنعة) له فهرست كبير يحتوي على جميع ما ألف في الصنعة وغيرها وله فهرست صغير يحتوي على ما ألف في الصنعة فقط قال ونحن نذكر جملا من كتبه رأيناها وشاهدها الثقات فذكروها لنا (أقول) أوردها ابن النديم بذكر لفظ كتاب في أول كل اسم منها ونحن حذفنا لفظة كتاب اختصارا إلا قليلا وذكر إسماعيل مظهر في تاريخ الفكر العربي بعض الخصوصيات المتعلقة بهذه المؤلفات فنحن نذكرها كلا في موضعه قال ابن النديم فمن ذلك: ١ - اسطقس الأس الأول إلى البرامكة، ٢ - اسطقس الأس الثاني إليهم، ٣ - الكمال هو الثالث إليهم، نقلت هذه الثلاثة بالزنكوغراف في الهند سنة ١٨٩١ م، ٤ - الواحد الكبير - ويقال الواحد الأول -، ٥ - الواحد الصغير - ويقال الواحد الثاني - من الكتابين نسختان في المكتبة الأهلية بباريس ٦ - الركن، ٧ - البيان، نقل بالزنكوغراف في الهند سنة ١٨٩١ م، ٨ - الترتيب ٩ النور، نقل بالزنكوغراف في الهند سنة ١٨٩١ م، ١٠ - الصبغ الأحمر، ١١ - الخمائر الكبير، ١٢ - الخمائر الصغير، ١٣ - التدابير الرائية، ١٤ - كتاب يعرف بالثالث، ١٥ - الروح، ١٦ - الزئبق طبع برتيلو المؤلف الفرنسوي كتابين أحدهما باسم كتاب الزئبق الشرقي والآخر باسم الزئبق الغربي نقلهما من مكتبة ليون، ١٧ - الملاغم الجوانية، ١٨ - الملاغم البرانية، والملاغم من مصطلحات أهل الكيمياء يراد بها خليط من معدن وزئبق، ١٩ - العمالقة الكبير، ٢٠ - العمالقة الصغير، ٢١ - البحر الزاخر، ٢٢ - البيض، ٢٣ - الدم، ٢٤ - الشعر - منه نسخة بالمتحف البريطاني -، ٢٥ - النبات ٢٦ - الاستيفاء، ٢٧ - الحكمة المصونة، ٢٨ - التبويب - منه نسخة بالمتحف البريطاني، ٢٩ - الأملاح، ٣٠ - الأحجار - نقل بالزنكوغراف في الهند سنة ١٨٩١، ٣١ - كتاب أبي قلمون (أقول) أبو قلمون طائر من طير الماء يتراءى بألوان شتى - وثوب رومي يتلون ألوانا شبه بالطائر، ٣٢ - التدوير، ٣٣ - الباهر، ٣٤ - التكرير، ٣٥ - الدرة المكنونة، وفي المتحف البريطاني مخطوطة بهذا العنوان ضمن مؤلفات جابر بن حيان، ٣٦ - كتاب البدوح، (أقول) ب دوح يقال إنه طلسم يفيد السرعة والإنجاز ولذلك يكتبونه على الرسائل وعلى الحوامل عند عسر الولادة وقد يبدل بأرقام هذين بحساب الجمل [٨٦٤٢]، ٣٧ - الخالص، ٣٨ - الحاوي، ٣٩ - كتاب القمر - أي كتاب الفضة -، ٤٠ - كتاب الشمس - أي كتاب الذهب - قال إسماعيل مظهر يرجح أنه مختصر عن كتاب الأحجار السبعة وقد ذكره الجلدقي في نهاية المطلب منه نسخة في المكتبة الأهلية بباريس اه، ٤١ - التركيب - أو التراكيب - منه نسخة بالمكتبة الأهلية بباريس -، ٤٢ - الفقه، ٤٣ - الأسطقس - قال إسماعيل مظهر يظهر أنه هو الجزء الثالث من كتاب الأسطقس اه، ٤٤ - الحيوان - وذكره الجلدقي بعنوان حياة الحيوان، ٤٥ - البول، ٤٦ - التدابير اخر، ٤٧ - الأسرار - ولعله كتاب سر الأسرار الذي منه نسخة بالمتحف البريطاني - أقول: يأتي في مؤلفاته سفر الأسرار ولعله تصحيف سر الأسرار أو بالعكس، ٤٨ - كيمان المعادن، ٤٩ - الكيفية، ٥٠ - السماء أولى، ٥١ - وثانية، ٥٢ - وثالثة، ٥٣ - ورابعة، ٥٤ - وخامسة، ٥٥ - وسادسة، ٥٦ - وسابعة، ٥٧ - الأرض أولى، ٥٨ - وثانية، ٥٩ - وثالثة، ٦٠ - ورابعة، ٦١ - وخامسة، ٦٢ - وسادسة، ٦٣ - وسابعة، ٦٤ - المجردات، ٦٥ - البيض الثاني، ٦٦ - الحيوان الثاني، ٦٧ - الأملاح الثاني، ٦٨ - الباب الثاني، ٦٩ - الأحجار الثاني، ٧٠ - الكامل، ٧١ - الطرح، ٧٢ - فضلات الخمائر، ٧٣ - العنصر، ٧٤ - التركيب الثاني - منه نسخة بالمكتبة الأهلية بباريس -، ٧٥ - الخواص منه نسخة مخطوطة بالمتحف البريطاني، ٧٦ - التذكير - في المتحف البريطاني مخطوطة بهذا العنوان ضمن مؤلفات جابر، ٧٧ - البستان، ٧٨ - السيول، ٧٩ - روحانية عطارد، ٨٠ - الإستتمام - ذكر الطغرائي بعض مقطوعات منه وذكره الجلدقي في نهاية المطلب، ٨١ - الأنواع، ٨٢ - البرهان، ٨٣ - الجواهر الكبير، ٨٤ - الأصباع، ٨٥ - الرائحة الكبير، ٨٦ - الرائحة اللطيف، ٨٧ - المني، ٨٨ - الطين، ٨٩ - الملح، ٩٠ - الحجر الحق الأعظم، ٩١ - الألبان، ٩٢ - الطبيعة، ٩٣ - ما بعد الطبيعة، ٩٤ - التلميح، ٩٥ - الفاخر، ٩٦ - الصارع، ٩٧ - الأفرند، ٩٨ - الصادق، ٩٩ - الروضة وذكره الجلدقي في الجزء الثامن من نهاية المطلب، ١٠٠ - الزاهر ١٠١ - التاج، ١٠٢ - الخيال، ١٠٣ - تقدمة المعرفة، ١٠٤ - الزرانيخ، ١٠٥ - كتاب إلهي، ١٠٦ - كتاب إلى خاطف، ١٠٧ - كتاب إلى جمهور الفرنجي، ١٠٨ - كتاب إلى علي بن يقطين، ١٠٩ - مزارع الصناعة، ١١٠ - كتاب إلى علي بن إسحاق البرمكي، ١١١ - التصريف، ١١٢ - الهدى، ١١٣ - تليين الحجارة إلى منصور بن أحمد البرمكي، ١١٤ - أغراض الصنعة إلى جعفر بن يحيى البرمكي، ١١٥ - الباهت، ١١٦ - عرض الأعراض - قال ابن النديم وهذه الكتب مائة واثنا عشر كتابا (أقول) لا يخفى أنها ١١٦ - فكأنه وقع تكرير في بعضها قال: وله بعد ذلك سبعون كتابا منها: ١١٧ - اللاهوت، ١١٨ - الباب، ١١٩ - الثلاثون كلمة، ١٢٠ - المنى، ١٢١ - الهدى، ١٢٢ - الصفات، ١٢٣ - العشرة، ١٢٤ - النعوت، ١٢٥ - العهد، ١٢٦ - السبعة، - وفي تاريخ الفكر العربي كتاب السبعين في المتحف البريطاني فأما صحف أحدهما بالآخر أو هما اثنان، ١٢٧ - الحي، ١٢٨ - الحكومة، ١٢٩ - البلاغة، ١٣٠ - المشاكلة، ١٣١ - خمسة عشر - منه نسخة في مكتبة جامعة ترينتي باكسفورد، ١٣٢ - الكفؤ، ١٣٣ - الإحاطة، ١٣٤ - الرواق، ١٣٥ - القبة، ١٣٦ - الضبط، ١٣٧ - الأشجار، ١٣٨ - المواهب، ١٣٩ - المخنقة، ١٤٠ - الإكليل، ١٤١ -