فرتب المسائل والجوابات على ثلاثة أنواع منها ما أجاب عنه العلامة ، وما أجاب عنه الفخر ، وما أجابا عنه ، والجامع لها بهذا الترتيب أخذا الجميع عن خط السائل والمجيب هو ابن أخي السيد علاء الدين بن زهرة المذكور حيث يعبر عنه كثيرا بالشيخ العم ، فهو إما أنه أمين الدين أبو طالب أحمد أو هو عز الدين أبو محمد الحسن أبناء بدر الدين محمد أخو السيد علاء الدين علي وهما ابنا إبراهيم بن محمد بن علي بن الحسن بن أبي المحاسن زهرة.

( ٣٤٠٨ : مسائل الشيخ علي بن هلال الكركي ) تسعة وعشرون مسألة فقهية ، عند السيد أبو القاسم الخوانساري ، من كتب الشيخ منصور الصاعدي ، كتبه بأمر بعض الأمراء وأهداه إليه وألحق بآخره بعض مسائل الاستنجاء عام البلوى وأكثر النقل فيه عن الشهيد الثاني رحمه‌الله أوله : [ الحمد لله على جزيل نواله ] كتابته ١١٣١.

( مسائل العويص ) مر بعنوان العويص في العين وهي موجودة.

( ٣٤٠٩ : مسائل العويصة ) التي أرسلها إلى الشيخ أحمد الأحسائي في ثلاث دفعات ، كلها للشيخ أحمد بن صالح بن طوق القطيفي المعاصر للشيخ أحمد الأحسائي وجوامع كلمة محتو على المسائل وجواباته.

( ٣٤١٠ : مسائل الغيبة ) وهي ثلاث مسائل للشيخ المفيد ، موجودة في خزانة مولانا الميرزا محمد الطهراني ، مرت في الغين بعنوان كتاب الغيبة وهي غير المسائل العشرة في الغيبة.

( ٣٤١١ : المسائل الغير المنصوصة ) للمحقق الآغا رضي الدين محمد بن الحسن المعروف بآغا رضي القزويني ، صاحب لسان الخواص المتوفى سنة ست وتسعين وألف.

( ٣٤١٢ : مسائل الفتح بن يزيد ) أبي عبد الله الجرجاني ، رواه عنه النجاشي بإسناده إليه.

( المسائل الفخرية ) مر في جواباتها ( ج ٥ ).