هشتم صفر ١٤١٣ ق ١٧ مرداد ١٣١٧ ش، براى هميشه خاموش شد و مسلمانان را با اندوهى جانكاه مواجه كرد.
او كه جدّش حضرت موسى بن جعفر عليّه السلام به طاغوت عصر خود مبتلا شده بود، پس از وفات نيز همانند جدّه مظلومه‌اش حضرت زهرا.(سلام الله عليها).به خاك سپرده شد.
در نيمه‌هاى شب با حضور مأموران امنيتى رژيم بعث، پيكر پاكش غريبانه و مظلومانه و بدون تشييع، پس از نماز توسط حضرت آيت الله حاج سيد على سيستانى، آقاى بروجردى، آقاى سيد محمد تقى خوئى و دو نفر ديگر در مسجد خضراء سر به تيره تراب سپرد.
انتشار اين خبر موجب برقرارى حكومت نظامى در نجف و كوفه و آماده‌باش نيروهاى نظامى در بغداد، شهرهاى مركزى و جنوبى عراق و منع گردهمائى در اين دو شهر و تفتيش افراد و اتومبيل‌ها شده و مأموران حكومتى در نقاط ورودى اين دو شهر و اطراف صحن حضرت على عليه السّلام و منزل ايشان در كوفه مستقر شدند و از برگزارى هرگونه مجلس يادبود و گرامى‌داشت از سوى بيت و مقلّدين و وكلاى ايشان جلوگيرى شد.
اما در ايران، از نخستين ساعات بامداد روز نهم صفر صداى قرآن از راديو و مأذنه‌هاى حسينيه‌ها و مساجد پخش شد و از سوى دولت جمهورى اسلامى سه روز عزاى عمومى اعلام شد، و تمام در و ديوار شهرها و روستاها سياه‌پوش گرديد، و مردم به نوحه‌خوانى و عزادارى پرداختند.
از سوى رهبر انقلاب، مراجع تقليد و علماى اعلام، رؤساى قواى مجريه، مقننه و قضاييه شخصيّت‌ها، نهادها، سازمان‌ها، انجمن‌هاى اسلامى، هيئت‌هاى مذهبى، پيام‌هاى تسليت صادر و مجالس بزرگداشت بسيار برگزار گرديد.
همچنين شعرا به مرثيه‌سرايى و خطبا به سخنرانى در عظمت مقام علمى و