٨ شهريور شهادت شهيد رجايى و باهنر به دنبال عزل بنى‌صدر از رياست جمهورى، شهيد رجايى با رأى اكثريت مردم به رياست جمهورى انتخاب شد. دشمنان قسم خورده انقلاب كه توان تحمل وجود چنين عنصر ارزشمند و دلسوزى را نداشتند، در هشتم شهريور ماه ١٣٦٠ او را به همراه يار ديرينه‌اش شهيد محمدجواد باهنر در انفجار دفتر نخست‌وزيرى به شهادت رساندند.
مرحوم آقاى رجايى كه همه مى‌دانيد چقدر مرد متعهدى و خدمتگزارى بود و واقعاً معلم اخلاق بود و اعمال خودش. و همين‌طور آقاى باهنر كه مرد دانشمند متعهد و معلمى بود.
ج ١٨، ص ٨٢ من در مطالعاتى كه در ايشان [شهيد رجايى‌] كردم به نظرم آمد كه از حال دستفروشى‌اش تا حال رياست جمهور، در روح او تأثيرى حاصل نشد.
اين‌طور نبود كه رياست در آنها تأثير كرده باشد، آنها در رياست تأثير كرده بودند؛ يعنى آنها رياست را آورده بودند زير چنگ خودشان، رياست آنها را نبرده بود تحت لواى خودش. و اين يك درسى است كه انسان بايد از اينها يادبگيرد. ج ٢٠، ص ٣٥ در عين حال كه شهادت اين دو بزرگوار براى من بسيار مشكل است ...