روى عنه البخاري تعليقا أو أبو داود وروى الترمذي في الشمائل والنسائي وابن ماجة له بواسطة عبد الله بن عبد الرحمن الدارمي ومحمد بن يحيى الذهلي وسهل بن صالح الأنطاكي وأبي الأزهر أحمد بن الأزهر بن يعقوب الجوزجاني ومحمد بن عبد الرحمن بن الأشعث ومحمد بن عامر الأنطاكي وعمرو بن منصور النسائي وأبو حاتم والحسن بن علي الخلال وموسى بن سعيد الدنداني وموسى بن سهل الرملي وعبد الكريم بن الهيثم الدير عاقولي وطالب بن قرة الأوني وابنه جعفر بن محمد بن عيسى وابن أخيه محمد بن يوسف بن عيسى بن الطباع وأحمد بن خليد الحلبي وأحمد بن عبد الوهاب بن نجدة الحوطي وآخرون قال الأثرم عن أحمد أن بن الطباع لبيب كيس قال وسمعت أبا عبد الله ذكر حديث هشيم عن بن شبرمة عن الشعبي في الذي يصوم في كفارة ثم يؤسر فقال لا أراه سمعه قيل له فإن أبا جعفر محمد بن عيسى يقول فيه قال أنا بن شبرمة قال فتعجب فقلت له إلا أن أبا جعفر عالم بهذا قال نعم وقال البخاري سمعت عليا قال سمعت يحيى وعبد الرحمن يسألان محمد بن عيسى عن حديث هشيم وما أعلم أحدا أعلم به منه وقال أبو حاتم سمعت محمد بن عيسى يقول اختلف عبد الرحمن بن مهدي وأبو داود في حديث لهشيم فتراضيا بي وقال أبو حاتم أيضا حدثنا محمد بن عيسى بن الطباع الفقيه المأمون ما رأيت من المحدثين أحفظ للأبواب منه قال بن أبي حاتم سئل أبي عن محمد وإسحاق ابني عيسى بن الطباع فقال محمد أحب إلي وقال إسحاق أجل ومحمد أتقن وقال أبو داود محمد بن بكار يقول