أستاذه لإجازته في طبعها، كان بعض ممن يخالف معترضا على الإمام الخوئي موافقته على ذلك، بحجج واهية غير مستندة على منطق سليم، كعمر الطالب وانتمائه القومي، وكان الإمام الخوئي يقول في ردهم: إن المناط هو علم الطالب وفضله، وما يدل من تقريراته على جده واجتهاده وذكائه وعمله الدؤوب ومتابعته وقوة ملاحظاته، وليس المناط عمره، فإنه كانت الاعتراضات هذه وشبهها على أساس صغر سني آنذاك، تحاول منع أستاذي الشيخ النائيني رحمه الله، من إجازته طبع تقريرات بحوثه التي كتبتها (أجود التقريرات) فإنه يجب إنصاف الحق وإعطاء كل ذي حق حقه، كما ينبغي تشجيع المجد والمثابر ودعمه في الاستمرار على ذلك النهج.

وبالفعل فقد أجاز الأستاذ طبع التقريرات تلك، مع الإشادة المناسبة بمقررها، وهكذا كان الإمام الخوئي مع جميع تلامذته المجتهدين. ويقول سماحة الشيخ الفياض في مقدمة تلك التقريرات ما هذا نصه:

بسم الله الرحمن الرحيم‌

والحمد لله رب العالمين والصلاة والسلام على خير خلقه محمد وآله الطاهرين، واللعنة الدائمة على أعدائهم أجمعين،