البحر، وحيثما يزيد الارتفاع عن ذلك يختفي المناخ الاستوائي الحقيقي وتحل محله أنواع معدلة من المناخ المداري، وقد تظهر بعض أنواع المناخ البارد على القمم المرتفعة التي توجد على الحافة الشرقية للحوض.
ومن الطبيعي أن يكون الهواء الذي يسود في حوض الكونغو هو الهواء المداري خصوصًا الهواء المداري البحري الذي يصل إليه من المحيط الأطلسي الجنوبي في الغرب ومن المحيط الهندي في الشرق، أما الهواء المداري القاري فعلى الرغم من أنه يصل كذلك إلى حوض الكونغو من المناطق الواقعة إلى الشمال منه إلا أن ذلك مقصور على بعض أشهر فصل الشتاء "يناير"K حيث يصل بعض هذا الهواء إلى القسم الشمالي والأوسط من الحوض، وفي نفس هذا الفصل يتأثر مناخ القسم الجنوبي الغربي من حوض الكونغو بتيارات مماثلة تصل إليه من المحيط الهندي، وهذا الهواء المداري الرطب، سواء منه ما يصل من المحيط الأطلسي أو ما يصل من المحيط الهندي، وهو المصدر الذي يغذي الأمطار التي تسقط على حوض الكونغو في هذا الفصل "الشتاء الشمالي".
أما في فصل الصيف فيختفي الهواء المداري القاري من حوض الكونغو تمامًا، ويحل محله الهواء المداري البحري خصوصًا الهواء الذي يأتي من المحيط الأطلسي وذلك لأن اشتداد عمق الضغط المنخفض الذي يتكون على الصحراء الكبرى في هذا الفصل يساعد على اجتذاب الرياح الجنوبية الغربية التي تهب من ناحية هذا المحيط وعلى زيادة سرعتها نسبيًّا، والهواء الرطب الذي تحمله هذه الرياح هو المصدر الذي تأتي منه الأمطار التي تسقط في الفترة من إبريل إلى أكتوبر "الصيف الشمالي".
ويلاحظ عمومًا أن الرياح السائدة على حوض الكونغو أغلبها رياح خفيفة كما أن فترات سكون الهواء كثيرة جدًّا، ومع كل هذا فإن الإقليم يتعرض في فصلي الربيع والخريف، وهما فصلا تعامد الشمس على خط الاستواء لظهور عواصف شديدة تشتهر باسم الترنادو، وهي من نفس نوع عواصف الترنادو