كتاب نهاية الاحكام في معرفة الاحكام [١].
كتاب تهذيب النفس [٢] في معرفة المذاهب الخمس.
كتاب تنقيح قواعد الدين [٣] المأخوذة عن آل يس عدة أجزاء.
كتاب الرسالة العزية [٤].
كتاب المنهاج في مناسك الحاج [٥].
كتاب نهج الايمان [٦] في تفسير القرآن ذكرنا فيه تلخيص الكشاف والتبيان و مجمع البيان وغيرها.
كتاب الأدعية الفاخرة [٧] المنقولة عن الأئمة الطاهرة أربعة أجزاء.
في الأحاديث كتاب استقصاء الاعتبار [٨] في تحرير معاني الأخبار ذكرنا فيه كل حديث وصل إلينا وبحثنا في كل حديث منه على صحة السند وإبطاله وكون متنه محكما أو متشابها، وما اشتمل عليه المتن من المباحث الأصولية والأدبية، وما يستنبط من المتن من الأحكام الشرعية وغيرها، وهو كتاب لم يعمل مثله.
كتاب مصابيح الأنوار [٩] ذكرنا فيه كل أحاديث علمائنا وجعلنا كل حديث يتعلق بفن في بابه ورتبنا كل فن على أبواب ابتدأنا فيها بما روى عن النبي صلى الله عليه وآله ثم من بعده بما روى عن علي عليه السلام وهكذا إلى آخر الأئمة الاثني عشر عليهم السلام.
كتاب النهج الوضاح [١٠] في الأحاديث الصحاح.
كتاب الدر والمرجان [١١] في الأحاديث الصحاح والحسان عشرة أجزاء.
كتاب كشف المقال [١٢] في معرفة الرجال أربعة أجزاء.